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丹参鉴定学专论ppt课件

* 1丹参主要居群DNA指纹图谱的建立 2丹参EST序列中SSR信息的分析及建立 * 丹参主要居群DNA指纹图谱的建立 基因组DNA的提取 编号 名称 来源 花颜色 Al 大叶丹参 四川中江 紫色 A2 商洛丹参 陕西商洛 紫色 A3 首县紫花丹参 山东芭县 紫色 A4 四倍体丹参 中国药科大学 紫色 A5 芭县白花丹参 山东芭县 紫色 A6 北京丹参 中国中医药研究院 紫色 A7 毫州丹参 安徽亳州 紫色 A8 丙城丹参 山西茵城 紫色 A9 江苏丹参 江苏射阳 紫色 A10 小叶丹参 四川中江 紫色 A11 安国丹参 河北安国 紫色 A12 甘西鼠尾草 甘肃 紫色 A13 一串红 陕西省杂交油菜研究中心 红色 A14 油菜 陕西省杂交油菜研究中心 黄色 A15 小麦 陕西省杂交油菜研究中心 注:Al一Al,为各居群编号,以下同。 * RAPD一PCR扩增反应体系及扩增程序的优化 别设计M扩+、Taq酶、模板DNA的浓度及退火温度等单因子试验,同时保持扩增体系的其它成分浓度及扩增程序其它环节不变,以优化、确证适宜的M扩+、Taq酶、模板DNA的浓度及退火温度。 * 鉴别丹参与其近缘和远缘植物的特征引物及其DNA指纹图谱   引物s2035、s222扩增结果不仅稳定、条带明亮,而且采用引物s2035、s232建立的指纹图谱丹参主产区的n个居群丹参的PCR扩增带型几乎相同(1一n泳道),其中有200一1100bp的七条共同的特异条带,即图6的条带Cl、CZ、C3、 C4、图7的CS、C6、C7,各丹参居群完全相同。 * 结果验证:结果验证显示,PCR扩增重复性较好,取样合理,能够代表各居群。 * 丹参EST序列中SSR信息的分析及建立 丹参EST序列中SSR信息的分析 微卫星(Microsatellite)又称简单重复序列(Simplesequence repeat),指的是基因组中由 1~6 个核苷酸组成的基本单位重复多次构成的一段 DNA,广泛分布于基因组的不同位置,长度一般在 200bp 以下SsR 分子标记具有数量丰富,多性高,多等位基因,共显性,重复性高等优点。根据建立 SSR 标记的序列性质不同可分为基因组 SSR (Genomic SSR,gSSR) 和表达序列标签 SSR(Expressed sequence tag SSR,EST-SSR)。EST 及表达序列标签是通过从 cDNA 文库中随机挑选的克

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