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绪论
分子生物学
广义:从分子的形式来研究生物现象的学科 。
狭义:从分子水平理解生命活动,主要指遗传信息的传递(复制)、保持(损伤和修复)、基因的表达(转录和翻译)与调控。
DNA是遗传物质被证实
1944年,Avery O.T. 肺炎双球菌转化实验
1)DNA在原核生物中是遗传物质
1928 Griffith, 无毒菌株与杀死的有毒菌株混合,即可致病;
1944 Avery, 肺炎链球菌转化(transform)实验(DNA提取和转化)
2)T2 噬菌体的遗传物质被证明是DNA(捣碎实验)。
3)真核细胞通过DNA转染(transfection)获得新的表型
基因(gene):能够表达和产生基因产物(蛋白质或RNA)DNA序列。可分为蛋白质基因和RNA基因;按功能可分为结构基因和调节基因。
基因组(genome):一生物体内所有的基因。现一般指生物体内所有的DNA序列。
E.coli 的重要性:在实验室中容易操作 ;生长迅速,只要求简单的营养物质 ;能进行很多生理生化过程 ;E.coli是发现存在有性生殖的第一种细菌
第二章
提出双螺旋结构的依据
各种生物物理资料(DNA纤维中的水含量)
X-ray衍射图谱(Rosalind Franklin 完成)
碱基比( Chargaff 完成)
核酸的种类( RNA、DNA)
① 核糖核酸(ribonucleic acid-RNA):
转移RNA(transfer RNA-tRNA) 、信使RNA(messenger RNA-mRNA)、核糖体RNA(ribosomal RNA-rRNA)
小分子细胞核RNA(snRNA)、染色质RNA(chRNA)、反义RNA(antisense RNA)、双链RNA(dsRNA)、细胞质小RNA(scRNA)、具有催化活性的RNA(ribozyme)、各种病毒RNA
②脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid- DNA)
核酸的功能:DNA是主要的遗传物质(转化作用)
遗传信息的载体,负责遗传信息的 贮存和发布。
RNA的功能:
1.参与蛋白质的合成
rRNA(75-80%) tRNA(10-15%) mRNA(2-5%)
2.遗传物质
3.具有生物催化剂功能
核酸的元素组成有两个特点:
1. 一般不2. P含量较多,并且恒定(9%-10%)。 因此,实验室中用定磷法进行核酸的定量分析。(DNA9.9% 、RNA9.5%)含S。
核酸(DNA和RNA)是一种线性多聚核苷酸,它的基本结构单元是核苷酸。
核苷酸本身由核苷和磷酸组成
RNA的分子结构(RNA structure)
RNA一级结构研究最多的是tRNA、rRNA以及一些小分子的RNA。组成RNA的核苷酸也是以3 ′-5 ′磷酸二酯键连接。
模型构建(Watson Crick 完成)
RNA的高级结构特点:RNA是单链分子,因此,在RNA分子中,并不遵守碱基种类的数量比例关系,即分子中的嘌呤碱基总数不一定等于嘧啶碱基的总数。
RNA分子中,部分区域也能形成双螺旋结构(类似A-DNA双螺旋结构),不能形成双螺旋的部分,则形成突环。这种结构可以形象地称为“发夹型”结构或茎环结构。
超螺旋(supercoil/superhelix)---DNA的高级结构
定义: DNA的高级结构指DNA分子(双螺旋)通过扭曲和折叠所形成的特定构象。包括不同二级结构单元间、单链与二级结构单元间的相互作用以及DNA的拓扑特征。
超螺旋是DNA高级结构的主要形式。可分为正超螺旋和负超螺旋。
正超螺旋(positive supercoil):DNA扭曲方向与双螺旋方向相同,形成正超螺旋(双链紧缠)
负超螺旋(negaive supercoil) DNA扭曲方向与双螺旋方向相反,形成正超螺旋(双链松缠)
两种超螺旋的自由能均高于松弛状态。
天然原核生物DNA都呈现哪一种超螺旋形式?为什么?
天然原核生物呈现负超螺旋
DNA负超螺旋易于解链,在DNA复制、重组和转录等过程中都需要两条链解开,所以负超螺旋利于这些功能的实施。
在体外可形成正超螺旋,如加入溴化乙锭(EtBr,EB),可引入正超螺旋。
EB插入DNA碱基之间
EB 嵌入剂
双螺旋结构的特点:
A与T,C与G配对,以氢键结合;
双链反向平行(以5’~3’为正方向),从两端看结构相同。
两条主链由脱氧核糖和3’-5’磷酸二酯键交互连接而成;碱基位于内侧
基本参数
直径:2.0 nm;
螺距:3.4 nm;
每匝 10 bp/10.5bp
每一碱基对比另一对沿轴旋转36°
大沟含较多信息,为复制,转录部位;
小沟具一定调节功能
三种DNA结构特性比较
A-DNA
B-DNA(含水量92%)脱水后变形为A-DNA(含水7
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