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水稻外观品质性状和千粒重QTLs分析
水稻外观品质性状和千粒重QTLs分析
摘要:通过以明恢63和优质泰国香米KDML105两个籼稻品种为亲本杂交的重组自交系(Recombinant inbred line, RIL)群体,构建包含134个简单重复序列标记(SSR)的遗传连锁图谱。2009、2010年对水稻(Oryza sativa L.)的粒长、粒宽、粒形、粒厚、腹白率、心白率和千粒重进行数量性状位点(QTL)定位。2009年检测到16个QTLs,其中粒长、粒宽、粒形、粒厚、腹白率、心白率和千粒重分别检测到2、2、1、1、1、1和8个QTLs,单个QTL可解释表型变异的4.43%~13.06%。2010年检测到19个QTLs,其中粒长、粒宽、粒形、粒厚、腹白率、心白率和千粒重分别检测到2、3、3、2、3、3和3个QTLs,单个QTL可解释表型变异的6.04%~24.31%。千粒重qTGW-3和qTGW-6-2在2009、2010年两年中均被重复检测到,qTGW-3在两年中分别可解释表型变异的13.06%和7.12%,qTGW-6-2在两年中分别可解释表型变异的7.66%和14.56%。
关键词:水稻(Oryza sativa L.);外观品质性状;千粒重;QTL
中图分类号:S511.2+1;Q943.2 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2012)19-4187-06
外观品质是水稻(Oryza sativa L.)的重要性状。水稻的外观品质主要由粒长、粒宽、长宽比、粒厚以及垩白决定。其中粒长、粒宽、长宽比以及粒厚通常称为粒形相关性状。水稻的粒形与水稻的产量性状密切相关[1],还与水稻的加工品质以及蒸煮食味品质等都存在着密切的关系[2]。垩白是水稻外观品质的重要性状,根据发生部位的不同可分为心白、腹白和背白。稻米垩白使稻米在加工的过程中容易破裂,导致整精米率下降,同时垩白米也使米饭的口感降低[3]。千粒重是水稻产量的重要决定因素,同时千粒重与垩白性状存在相关性[4,5]。随着我国人口的迅速增长,对水稻的产量提出了越来越高的要求??同时,随着经济发展和人们生活水平的提高,对稻米品质的要求也越来越高。优质的稻米不仅口感优良,垩白率低,而且要有美观的外形。因此,在提高水稻产量的基础上,改良稻米的品质,对于保障国家粮食安全以及提高人们生活水平有着重要的意义。通常认为,水稻的粒长、粒宽、粒厚以及长宽比都属于多基因控制的数量性状[6-10]。其中也不乏主效QTL,如GS3[11]、GW2[12]、qSW5[13]以及GW5[14]等主效基因。而粒重为粒长、粒宽和粒厚的综合指标,一般也认为粒重为多基因控制的数量性状[15,16]。本研究利用以明恢63与KDML105为亲本构建的RIL群体,通过分子标记构建遗传连锁图谱,对水稻的粒长、粒宽、粒形、粒厚、腹白率、心白率和千粒重进行QTL初步定位,为水稻产量提高与外观品质的遗传改良提供基础。
1 材料与方法
1.1 试验材料及各指标测定
利用由明恢63和KDML105构建的186个F7、F8 RIL群体,于2009、2010年分别种植于华中农业大学试验农场。每个家系种植两行,每行12株,成熟后按株系混收中间10株,自然干燥后置于室温下至少保存3个月后开始各性状的测定。每株系随机选取10粒饱满的谷粒进行粒长和粒宽的测定。以粒长/粒宽作为粒形的考查指标。根据垩白的位置,将垩白区分为腹白及心白分别进行考察,随机挑选100粒整精米分别对腹白率以及心白率进行考察。千粒重随机挑选200粒饱满的种子来称重,然后折算为千粒重。谷粒粒厚的测量方式为随机挑选10粒饱满的谷粒,对单个谷粒粒厚进行测量。每个指标设3个重复。
1.2 多态性标记筛选及RIL群体基因型统计
每个家系挑选中间单株,取叶片1~2 g,参照Temnykh等[17]和McCouch等[18]发表的水稻分子图谱,同时利用微卫星标记数据库所包含的引物信息对亲本间进行多态性标记筛选,将得到的多态性标记对RIL群体进行基因型鉴定,并记录各标记的群体基因型。
1.3 遗传连锁图谱的构建和QTL的定位
利用Mapmakr/EXP 3.0[19]软件构建明恢63×KDML105的RIL群体分子标记遗传连锁图谱,并利用WinQTLCart对粒长、粒宽、粒形、粒厚、腹白率、心白率和千粒重进行QTL初步定位,以LOD≥2.0为检测QTL的阈值。QTL按照MoCouch等[20]提出的规则进行命名。
2 结果与分析
2.1 连锁图谱的构建
累计对1 900对SSR标记进行筛选,共筛选到134个在亲本间有多态性的SSR标记,利用Mapmaker/Exp 3.0获得连锁图谱。134个标记共形成11个连锁群,第10染色体上没有找到可用多态性
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