霍奇金淋巴瘤和非霍奇金淋巴瘤中BRD2 基因和蛋白的表达课件.pptVIP

D. Banerjee 霍奇金淋巴瘤和非霍奇金淋巴瘤中BRD2 基因和蛋白的表达 D. Banerjee 探求HL的相关基因：策略 霍奇金细胞系的基因表达谱 OCI 人类27K Combo 阵列 （H8K + H19K 阵列） 包含 2 组阵列 （H8K 和 H19K）， 超过 27,000 人类克隆 对比UHRR（通用的人类参照RNA），发现HL中137个基因存在差别表达 使用Pathway-Express (PE) 软件分析基因列表 PE 生成受测基因参与的通路列表，列表中包括每个通路的P值，标示其相对重要性。 HL细胞系中差别表达基因的功能划分 KMH2 和 L428 细胞系的表达谱 BRD2 基因 - 1 BRD2=“bromodomain containing 2” 位于染色体6p21.32上II型组织相容复合物区的中间 Bromodomain基序见于转录调控相关蛋白 原始序列与同型不育雌果蝇 (fsh)相似, CPB/p300 和 RNA 聚合酶 II TATA 盒相关因子 (TAFII) 250 CBP和p300是许多调节造血细胞生成、p53、 TGF-beta 和GATA 1-3通路的转录因子的辅助因子 BRD2 基因 - 2 BRD2蛋白 (以往被称为 RING3 (really interesting new gene 3)) BET (bromodomains and extraterminal domain)家族成员 – 迄今已知有9 个成员。染色质重组中作为转录复合物的“骨架” 编码85 kDa的丝裂原活化激酶－定位于细胞核 BRD2 基因 – 3 伴淋巴组织限制Brd2过表达的转基因鼠 (E?-BRD2转基因鼠) 发生了脾脏B细胞淋巴瘤，其基因表达谱与人弥漫大B细胞淋巴瘤的表达谱相似 (Greenwald et al. Blood. 2004;103:1475-1484). 成纤维细胞中Brd2的过表达通过增加细胞周期蛋白A及其相关的周期蛋白依赖激酶活性加速了细胞周期 染色质免疫沉淀反应研究显示： Brd2 位于cyclin A 启动子上，当它具有转录活性时，其过表达促进启动子上组蛋白H4增强乙酰化，提示一种细胞周期蛋白A双向调节的新模式(Sinha, et al. Biochem J. 2005 April 1; 387: 257–269. ) Brd2 复合物中鉴定出的蛋白 (From: Denis, GV et al J Proteome Res 2006 5:502-511) 凋亡中 BRD2的作用 BRD2主要定位于细胞核，呈弥漫或点状分布 BRD2在启动凋亡中有独特作用 BRD2 在细胞核的点状分布模式可能是细胞凋亡的形态学标记 敲除BRD2可导致小鼠死亡 Brd2 -/-纯合子胚胎较小，并于胚胎11至12天死亡 BRD2 部位相关的幼年型肌阵挛性癫痫和光致惊厥发作反应 BRD2 (RING3)可能是普通幼年型肌阵挛性癫痫的主要易感基因 Pal DK et al. Am J Hum Genet. 2003 Aug;73:261-70 一种位于于染色体6p21的主要的JME基因位点(EJM1). JME 和BRD2 (RING3)基因间非常显著的连锁不平衡 (LD) DNA 测序显示在BRD2 (RING3) 启动子区2种JME-相关SNP亚型 BRD2 多态性与光致惊厥发作反应的关联 Lorenz S et al. Neurosci Lett. 2006;400:135-9. 光致惊厥发作反应(PPR) 的特殊位点已定位于6p21 PPR与6个BRD2多态性发现有等位基因及单倍型关联 PPR 和 JME 可共享致癫痫的通路 BRD2 可能是一种潜在的易感基因 COSMIC 数据库中BRD2基因突变（Sanger研究所） 分析的样本总数: 291 有突变的样本数: 5 突变发生于 胶质瘤 (3) 2 错义突变; 1 无义突变 胃癌 (2) 1错义突变; 1 框架缺失 人类癌症中发现有突变的518个蛋白激酶基因中BRD2排第19位 (即：属于最常见的前20个突变蛋白基因激酶之一) 6号染色体 – 显微切割霍奇金淋巴瘤RS细胞 霍奇金淋巴瘤BRD2 基因表达和拷贝数 霍奇金淋巴瘤细胞系KMH2, L428 和 L-1236 BRD2表达增加(OCI 人 27K Combo Array (H8K + H19K Arrays) ) L-1236 细胞，而非KMH2 或 L428 BRD2 基因扩增(BCCA SMRT Array CGH) 3/25临床样本显微切割RS细胞见基因扩增 反应性淋巴