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第十一章 因的调控与发育
一、原核生物基因的调控 二、真核生物基因的调控 1.染色体水平的调控 (1)染色体丢失 (2)染色体的扩增 染色体扩增的其本质是细胞内特定基因拷贝数专一性地大量增加。因此,也可称为基因的扩增(amplification)。 2.DNA水平的调控 (1)DNA重新拼接(重排) 细胞进行分化过程中,有些真核生物通过基因重排等方式在DNA水平上进行基因活性的调节。 (2)DNA的甲基化 真核生物DNA中大约20%~70%的胞嘧啶存在着甲基化修饰,其中以卫星序列的甲基化程度最高。 DNA甲基化抑制基因的活性,而去甲基化可以使基因恢复活性。 甲基化一般发生在CG/GC二核苷酸对上,如果二核苷酸对中的2个C都被甲基化,则称为完全甲基化,如果只有1个C被甲基化,则称为半甲基化。 DNA的甲基化对转录的抑制主要取决于甲基化CG对的密度和启动子的强度。 在同一组织不同细胞中甲基化在DNA上的位置总是一致的。 DNA的甲基化和去甲基化同基因活性的关系也不是绝对的。 哺乳动物体细胞的基因可以高度甲基化的非活化状态存在,也可以在诱导状态下去甲基化。或自始至终保持低水平甲基化(如持家基因)而具有转录活性。 一些低等真核生物如酵母、果蝇和其他双翅目昆虫中至今未发现甲基化。 有的基因如rDNA形成了容忍一定的甲基化的能力,能够在不发生去甲基化的情况下进行转录; 对于其它大多数基因,则是通过甲基化不足或去甲基化的方式来调节转录。 因此甲基化和去甲基化对基因表达调控的作用,随生物的不同种类而异,即便同一种生物,甲基化对不同基因活性也有不同效应。 对于其它大多数基因,则是通过甲基化不足或去甲基化的方式来调节转录。 3.转录水平的调控 顺式调控元件: 指DNA分子中对基因表达有调控作用的一段序列,其作用仅影响与其自身处于同一个DNA分子上的基因。 顺式调控元件不编码蛋白质,多位于基因旁侧或基因的内含子中。 反式调控元件: 是指能直接或间接识别或接合诸顺式元件8~12bp的核心序列,从而调控靶基因转录效率的接合蛋白,它可以调控一对同源染色体中任何一条中的靶基因。 (1)顺式调控元件 顺式调控元件包括启动子、增强子和沉默子(silencer)或称沉默基因。 启动子的调控作用与其DNA的甲基化密切有关。启动子的甲基化导致其靶基因的失活, 而去甲基化又能使其靶基因恢复活性。 增强子(enhancer)一般位于mRNA转录起始上游至少-100bp以上的地方。 在真核细胞中,增强子可通过启动子来增强转录效率,是一种远端控制元件,所以又称上游激活序列或远上游序列。 增强子也要通过与特定的转录因子(反式调控因子)结合而实现其对转录的增强作用。 增强子的效应非常显著,一般能使基因转录频率增加10—200倍,有的甚至可以高达上千倍。 例如人珠蛋白基因的表达水平在巨细胞病毒(cytomegalovirus,CMV)的增强子作用下可提高600—1000倍。 这也提示增强子可能没有种属特异性。 沉默子是一种类似增强子但起负调控作用的顺式元件。 沉默子被它相应的反式因子结合后,可以抑制靶基因的转录。 沉默子有点类似细菌的操纵基因。操纵基因与阻遏物结合后可抑制结构基因的转录。阻遏物可看成是原核生物中的反式调控因子。 沉默子这类负调控元件可以不受距离和方向的限制,并且可能不具有种属特异性,也能对异源基因的表达起作用。 至于它如何实现“沉默”效应,其机制目前尚不清楚。 (2)反式调控元件 反式调控元件一般都具有不同功能的结构域。 反式调控元件的基本结构中有3个主要的功能结构域: ①DNA识别或DNA结合结构域; ②激活基因转录的功能结构域; ③结合其他因子或调控蛋白的调节结构域。 反式调控元件中的DNA识别或DNA结合结构域通常称为基序(motif)。 目前“锌指” (zinc finger)基序的研究比较热门。 “锌指”基序是一个蛋白质结构域,由重复的半胱氨酸和组氨酸或重复的半胱氨酸在一个金属锌离子四周形成一个四面体的排列。 基序因在锌结合位点上突出的氨基酸环的形状如同手指,所以称为“指状”结构。 这种蛋白质结构域是同DNA或RNA结合的部位。 “锌指”结构域最初是在爪蟾的RNA聚合酶Ⅲ转录因子(TFⅢA)中发现的。 TFⅢA是一种典型的反式调控元件。这是9个串联重复的锌指区,每个单位大约由30个氨基酸残基组成。 许多种调控蛋白质都有数目不等的“锌指”结构。 与金属离子螯合的指状结构是许多种核酸结合蛋白质的共同结构。 在人、鼠、果蝇中都有发现锌指结构 一个锌指结构的保守序列是: Cys-X2-Cys-X,-Phe-X5-His- X2-His。 这里X2、X5代表2个和5个任何一种氨基酸基团。 (3)组蛋白与非组蛋白 的调控作用 组蛋白和非组蛋白在某些方面类似
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