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RNA提第一步
RT-PCR三部曲 RNA提取-第一步 提取RNA器械的处理 玻璃、不锈钢器皿:180度干烤4~6小时 (不离人) 塑料制品: -高压灭菌,烘干 -DEPC水浸泡过夜,捞出沥干水分(很重要),烘干 -电泳槽可用0.5M的NaOH浸泡20min RNA提取所需试剂和器皿清单 干烤的物品: 玻璃器皿:1000~2000ml的大烧杯(浸泡Tip)、100ml的量筒(配乙醇用)、带玻璃塞子的玻璃瓶3个(装异丙醇、氯仿、75%的乙醇) 铝饭盒(放ET管)、镊子(夹Tip和EP管用) 处理的塑料制品: 枪头(1000ul/200ul/20ul) EP管(1.5ml、200ul) EP管盒子(要与枪头配套) 制剂: DEPC、Trizol 异丙醇、氯仿、乙醇(未开封的) 电泳缓冲液、琼脂糖、EB DEPC(焦碳酸二乙酯) DEPC水, A:配制好未消毒;蒸馏水中加入0.1%DEPC,室温搅拌4小时以上至完全溶解。 作用:处理RNA提取的器材(不能干烤的物品) 浸泡过夜 B:配制好已消毒。高压灭菌20分钟,冷却备用。(通过高压消毒,该物质会降解,从而无毒) 作用:配置75%乙醇,溶解RNA 防止RNA降解 有专门的RNA提取区域:避免人员流动 实验人员带口罩、帽子,勤换手套 快速操作 保证低温环境:降低环境温度、冰上操作(冰盒)、低温离心 1 Rnase是一种蛋白酶,能够降解RNA。2 皮肤、唾液3 这个酶高效稳定。要么在DEPC水中处理n小时,要么在160度高温烘烤6小时。此酶才会失效。 1 1mlTrizol/孔,室温放置5min,用吸管吹打吸取到EP管中;2 加200ul氯仿 剧烈振荡15s,室温放置2-3min;3 12000g 低温离心 15min;4 小心取上层水相,一般400-450ul就足够了(千万不要贪多)! 5 加入500ul异丙醇 摇匀(反复颠倒10次),室温放置10min; 6 12000g 低温离心 10min;7 75%乙醇 1ml 洗涤沉淀;8 7500g 离心 5min;(也可加大离心速度,这样RNA不易被倒掉)9 小心弃去乙醇(不要把RNA倒掉),用小Tip吸干净残余的乙醇(底部不要吸的太干, 室温干燥5-10min; 10 加20~30ul DEPC水溶解沉淀。 留取6ul,其余立即分装两份冻存(-80度) 2ul用于定量,余下用于跑胶 电泳---判断RNA完整性和是否有DNA污染 新鲜配置的电泳缓冲液 电泳时间不要太久,100~120V,10-15min足够了。 如何判断RNA的完整性: 最理想的RNA 定量 1:70(1ul+69ul的水) * * RNA提取 逆转录为cDNA PCR 什么是RNA酶Rnase? 降解的RNA是酱紫滴 * * * 降解的RNA是酱紫滴,条带间界限模糊,有拖尾,不过右边的降解还可容忍,可继续做下一步实验。为避免时间的延长导致降解的加重,宜立即逆转录,变成cDNA就安全了 降解的RNA是酱紫滴,条带间界限模糊,有拖尾,不过右边的降解还可容忍,可继续做下一步实验。为避免时间的延长导致降解的加重,宜立即逆转录,变成cDNA就安全了
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