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鸡肉质性状形成的分子调控机及主效基因定位
鸡肉质性状形成的 分子调控机制及主效基因定位;主要内容;研究背景;肉品质性状为微效多基因控制性状、受环境和遗传的调控
遗传学和营养学的研究都依赖于性状调控分子机制的解析
组学技术(全基因组关联研究、蛋白质组)的应用推动着复杂经济性状的分子机制的研究
;研究背景;蛋白质组学研究技术的最新进展
;利用 F2 资源群体,对鸡肉质和脂肪性状进行全基因组关联(GWAS)研究,旨在获得影响这些性状的主效基因或新基因
通过蛋白质谱分析鉴定影响肉鸡肌内脂肪发育相关的功能蛋白;F2资源群体构建;肉质、脂肪性状测定;60k SNP芯片测定和质量控制;广义线性模型(GLM)
压缩的混合线性模型(MLM)
Y = Gα + C1β + Sγ + Bδ + Kμ + e
Y:表型,G:基因型,C1为第一主成分,S和B分别性别和批次,K为亲缘关系矩阵,e为随机误差
Gα、Sγ和Bδ在模型中做固定效应,C1β在模型中做协变量,Kμ和e在模型中做随机效应
;结合MLM、GLM两种模型的结果; 基因组水平显著阈值确定
采用连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)修正的Bonferroni 校正对 P 值进行校正。计算所用 r2 阈值标准为0.2,得到独立的 SNP 和单倍型区组数为 16760
全基因组关联显著水平:2.98E-6
潜在关联显著水平:5.96E-5;肉质性状描述性统计结果;结果-胸肌肌内脂肪;4个基因在高(H)、低(L)肌内脂肪组中mRNA表达差异显著;4个基因在高(H)、低(L)肌内脂肪组中mRNA表达差异显著;TYRO3 蛋白酪氨酸激酶(TYRO3) 在细胞增殖分化中起作用,与人脂肪细胞大小相关(Lijnen et al., 2011)
微粒体谷胱甘肽S转移酶 1(MGST1)位于鉴定的鸡胸肌肌内脂肪的 QTL 内(Gao et al., 2011)); 是东北民猪和长白猪背最长肌中的一个差异表达基因
NTPCR 和 KPNA2 对肌肉发育及脂肪代谢的功能有待开展
;;2个基因在高(H)、低(L)腹脂重组中mRNA表达差异显著;;5个基因在高(H)、低(L)腹脂率组中mRNA表达差异显著;5个基因在高(H)、低(L)腹脂率组中基因表达差异显著;RET 原癌基因与脂肪沉积相关
利尿排钠肽 B 基因 NPPB 与肥胖和胰岛素抵抗相关
胆固醇元件结合转录因子1 SREBF1与脂肪分化和成脂作用相关
其他3个基因(I 型胶原蛋白a2;叉头框蛋??C1;丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶;液泡蛋白质分选因子4B)的功能有待验证;结果-肉色 亮度(L*);小结;;;;;;对筛选到得肉质性状相关候选基因进行深入的功能鉴定及通路分析
测定胚胎期胸肌蛋白表达谱,对蛋白质组学结果进行综合分析,确定调控不同时期肌肉及肌内脂肪发育的蛋白网络
;相关研究人员;敬请批评指正
预祝春节快乐!
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