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合成生物学相关文献（免费共享）摘要：通过将组成生物系统的各类单元模块化、标准化，合成生物学希望达成一种新的生物技术发展模式：即从主要开发里欧那个天然生物系统既有功能，变为用人工设计合成的生物系统来完成天然系统不能完成或者完成效率低的功能。合成生物学通过开展生物元件或者器件、生物途径等多个层次的工程化研究来实现上述目标。综述:Boyle PM,Silver PA.2009. Harnessing nature’s toolbox: regulatory elements for synthetic biology. J R Soc Interface, doi；10.1098.rsif.f8.0521.focusMcArthur IV GH，Fong SS.2010. Toward engineering synthetic microbial metabolism. J Biomed Biotechnol,doi:10.1155/2010/459760。综述了元器件工程（components engineering）、和途径工程（pathway engineering）的进展。Andrianantoandro E,Basu S,Karig D,et al.2006.Synthetic biology:new engineering rules for an emerging discipline. Mol Syst Biol,2:14-27。合成生物学元器件工程：利用不同调控机制的人工调控器件:Boyle PM,Silver PA.2009. Harnessing nature’s toolbox: regulatory elements for synthetic biology. J R Soc Interface, doi；10.1098.rsif.f8.0521.focus。系统的综述了国际上相关工作研究:细胞中的转录调控、RNA调控、蛋白质信号转导等生物调控机制都已经被成功的用于构建合成生物调控元件。转录调控Elowitz MB，Leibler S.2000. Asynthetic oscillatory network of transcriptional regulators. Nature,403:335。基于转录调控的合成调控器件：基因振荡器Stricker J,Cookson S,Bennett MR, et al.2008. A fast, robust and tunable synthetic gene oscillator. Mature 456：基因振荡器Ajo-Franklin CM, Drubin DA, Eskin JA, et al. 2007.Rational design of memory in eukaryotic cells. Genes Dev,21:2271-2276。对输入信号具有永久“记忆”功能的转录调节单元。Friedlland AE,Lu TK et al.2009. Synthetic gene networks that count. Science,324:1199-1202。计数器RNA的调控：Isaacs FJ,Dwyer DJ,Collins JJ.2006. RNA Synthetic biology. Nat biotechnol,24:545-554。位于5‘非翻译区（UTR）的Riboswitch可作为小分子感受器，用于小分子信号调控蛋白质的翻译。Win MN, Smolke CD.2008. Higher-order cellular information processing with synthetic RNA devices. Science 322:456-460。Riboswitch区域还可以和核酶相连，通过小分子控制核酶的催化功能。Bayer TS,Smoke CD.2005. Programmable ligandcontrolled riboregulators of eukaryotic gene expression. Nat Biotechnol,23:337。利用Riboswitch可设计感受单种小分子信号的“翻译开关”，在特定小分子存在时候实现（或解除）对特定mRNA的翻译机制，还可以实现用多种小分子信号的组合输入来调控蛋白质表达水平。Rinaudo K，Bleris L，Maddamsetti R，et al.2007. A universal RNAi-based logic evaluator that operates in mammalian cells. Nat Bio