Topos4.0分析拓扑简单流程---ZIF-8为例.docVIP

Topos4.0分析拓扑简单流程---ZIF-8为例打开topos4.0软件，在database里，点击“import”出现下面对话框，找到zif-8.cif文件，点击 “打开”出现下面对话框： “文件名”输入任意名字（如zif-8），“打开”，出现确认对话框，点击“yes”，用户代码 输入“1”，点击“OK”，文件导入完成，可以进行分析。首先，运行“IsoCryst”，点击图标， 出现新的界面，点击“Draw structure”，为便于分析金属zn原子的配位情况，可以左键点击任一个金属Zn原子，此时，选中的金属原子为黄色，工具栏中的“show selection only” 按钮也由灰色（不可选）变为黄色高亮显示， ，点击，只有该金属原子显示在图中。图中任意空白处点击右键，取消选择，金属原子颜色恢复，点击“growing structure” 按钮，即显示与该金属原子配位的所有原子（该示例中均为N原子），Zn为4-配位，4-连接节点。继续点击，3D结构显示。同样地，每个咪唑配体为2-连接节点。ZIF-8为高对称性结构，每个金属原子均为4-配位，4-连接节点，每个咪唑为桥连配体，2-连接节点。因此，上面的检查已经结束，可以进下一步。第二步，运行auto CN，点击图标，出现对话框点击option选项，点击matrix默认选择的“Spec.Cont.”和“vdW Cont”这2项