SSR亲子鉴定技术.pptVIP

影响微卫星亲子鉴定的因素 3. 上游等位基因扩增丢失(Upper allele dropout) 当等位基因的大小存在差异时,片段小的等位基因往往比片段大的等位基因扩增效率高，因此常导致较大的等位基因在杂合体中无法检测到。 多重PCR体系（multiplex PCR） 不同荧光标记(FAM, HEX, NED, er al.)，PCR反应完后将产物混合后上机 同一种荧光标记，几个SSR位点同时在一个PCR反应里面扩增 大大节省成本 微卫星亲子鉴定在水产动物上的应用 Bernatchez, L., Duchesne P., 2000. Individual-based genotype analysis in studies of parentage and population assignment: how many loci, how many alleles? Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences 57, 1–12. Jerry, D.R., Preston, N.P., Crocos, P. J., Keys, S., Meadows, J.R.S., Li, Y., 2006. Application of DNA parentage analyses for determining relative growth rates of Penaeus japonicus families reared in commercial ponds. Aquaculture 254, 171–181. Kim, S.G., Morishima, K., Satoh, N., Fujioka, T., Setsuo, S., Arai, K., 2007. Parentage assignment in hatchery population of brown sole Pleuronectes herzensteini by microsatellite DNA markers. Fisheries Science 73, 1087–1093 . Wang, H.P., Li, L., Geoff, W., Bonnie, B., Hong,Y., Gao, Z., Laura, T., O’Bryant, Paul., Dean, R., Russ, M., 2009. Evaluation of relative growth performance and genotype by environment effects for cross-bred yellow perch families reared in communal ponds using DNA parentage analyses. Aquaculture Research 40, 1363–1373. ……越来越多的水产动物育种项目在采用SSR标记进行家系来源鉴定 * 2.1 红细胞血型 此法常见于人类亲子鉴定 人类的血型通常分为 A 、 B 、 O 和 AB 四种。血型的遗传借助于细胞中的染色体。ABO 血型系统的基因位点在第 9 对染色体上。人的 ABO 血型受控于 A 、 B 、 O 三个基因，但每个人体细胞内的第 9 对染色体上只有两个 ABO 系统基因，即为 AO 、 AA 、 BO 、 BB 、 AB 、 OO 中的一对等位基因，其中 A 和 B 基因为显性基因， O 基因为隐性基因。 因此，用红细胞进行亲子鉴定，只能否定，不能肯定，也就是只能做亲权排除。 2.2 酶型 多态性同工酶 是指在同工酶中，那些由遗传所致，在不同个体之间表现出酶蛋白一级结构差异，并可根据这种差异将人群分为若干类型的同工 酶。 区带电泳 利用酶蛋白分子的电荷密度的差异，不同酶蛋白分子在介质中的迁移率不同，从而形成清晰的区带。 等电聚焦技术——根据酶蛋白分子的等电点不同，在pH梯度介质中，酶蛋白分子聚焦在相应的等电点pH位置上，形成狭窄而清晰的区带。 凝胶介质上酶区带的显现和鉴定酶蛋白分子经电泳分离以后，利用酶特异性的催化活性，使之显色，表现出特征性谱带，可据此作出同工酶型的判断。 酶谱技术：电泳和组织化学染色两种方法的联 合应用。 常见的其他几种多态性同工酶： 红细胞酸性磷酸酶（EAP） 酯酶Ｄ 谷丙转氨酶 乙二醛酶I 6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶 腺苷脱氨酶（ADA） 2.3 白细胞的抗原（HLA）型 HLA具有高度多态性 HLA-Ⅰ类基因产物为HLA-A，-B，-C抗原，由两条糖蛋白链构成，即重链和轻链 重链由HLA基因控制，具有多态性。轻链为β2微球蛋白，不由HLA基因控制，无多