厦门大学生命科学院生物化学课堂ppt课件第七章酶.pptVIP

厦门大学生命科学院生物化学课堂ppt课件第七章酶.ppt

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厦门大学生命科学院生物化学课堂ppt课件第七章酶

(二) 重要的抑制剂 1. 不可逆抑制剂 1.1 非专一性不可逆抑制剂: 有机磷化物、有机汞(砷)化物、重金属盐、烷化剂 青霉素、氰化物 1. 2 专一性的不可逆抑制剂 (考过) Ks型不可逆抑制剂:具有与酶的天然底物类似的结构。与酶结合后,利用所带的活性基团使酶的必需部位被共价修饰,抑制酶的活性。但所带的活泼基团也可以修饰酶的别的部位,所以该抑制剂的专一程度有限。又称为“亲和标记试剂”。 Kcat型不可逆抑制剂:也具有与酶的天然底物类似的结构,且本身能被酶作用,使潜伏的基团活化而作用于酶的必需基团,酶被不可逆失活。又称为“自杀性底物”。 2 . 可逆抑制剂 (1) 抗代谢物:磺胺药、5-FU(5—氟尿嘧啶)等 (2) 过渡态类似物: 化学结构类似于底物和酶结合的过渡形式的一类抑制剂。 四、影响酶作用的因素 1. 温度对酶反应的影响 2. pH对酶反应的影响 3. 激活剂对酶反应的影响 六、酶的作用机制 (一)酶的活性中心 酶的活性中心是指酶分子中能同底物结合并起催化反应的空间部位,包括结合位点和催化位点。酶的活性中心形态及酶的性质取决于整个酶的结构,最终取决于组成酶的肽链的氨基酸序列。 酶的活性中心的特点: (1)活性中心只占整个酶体积的很小的一部分; (2)活性中心是一个具有三维空间构型的实体; (3)底物和酶在活性中心的结合力属于弱相互作用; (4)活性中心通常是一个裂缝,适合于底物的进入。 (5)活性中心的结构具有柔性,是可变的。 (二) 研究酶活性部位的方法 1. 侧链基团的化学修饰法 a 非特异性的共价修饰法 b 特异性的共价修饰法 c 亲和标记法:与底物结构相似的共价修饰剂 如 TPCK、TLCK、TLME等。 2. X-射线晶体衍射法 3. 定点诱变法 定点突变的方法改变编码蛋白质的DNA的顺序,通过判断突变前后酶活性的变化来研究酶的活性中心。 生化反应得以进行需要克服的能垒包括: ⑷ 酶分子上催化功能基团的正确定位; 酶和底物的相互作用,可以克服以上的能垒: ⑴ 通过底物在酶分子表面的定位,可以大大提高底物的局部浓度; ⑵ 酶-底物的相互作用可以置换绝大多数的底物-水之间的氢键; ⑶ 酶-底物相互作用时释放的Binding energy可以补偿底物分子形变所需的热能; ⑷ 酶-底物的相互作用使酶发生诱导契合,这种形变又加强了酶-底物的相互作用; ⑴ 反应物的无规则运动; ⑵ 生物分子表面通过氢键形成的水化膜; ⑶ 底物分子电荷和结构的重新排布; (三)影响酶催化效率的因素 1. 酶和底物的邻近和定向效应 邻近效应是指通过底物在酶分子表面的定位从而大大提高底物的局部浓度,使反应速度加快的效应。 定向效应是指底物在酶的作用下,采取有利于反应进行的取向。 2. 酶和底物的诱导契合 底物在酶的作用下,某些基团的电子云密度发生改变,产生电子张力,底物分子形变,导致反应易于进行的效应。 3. 酸碱催化效应 酶通过向底物分子提供瞬时的质子或接受瞬时的质子而稳定酶-底物复合物,加快反应进行的效应。 4. 共价催化效应 酶和底物生成不稳定的共价中间物,该中间物容易转变成过渡态,从而大大降低反应活化能。共价催化的一般形式是酶的亲核基团对底物中亲电的碳原子进行亲核进攻。 慢 快 快 胰蛋白酶Ser195作为亲核试剂的示意图 5. 金属离子的催化效应 (1) Ionic interactions between an enzyme-bound metal and the substrate can help

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