肿瘤组织库的建立与管理课件.ppt

肿瘤组织库的建立与管理 研究目的 探讨分子生物学研究中肿瘤库的建库条件，标本的采集、保存和质量控制，以及肿瘤库的信息化管理等有关问题，创建肿瘤组织标本库，保护和合理利用肿瘤的标本资源，为临床和科学研究人员，提供合适数量的肿瘤标本促进肿瘤的研究。 目录 建库理论基础 材料与方法 结果 讨论 致谢 理论基础 一、建立组织库的三种模式 1.“银行”模式 2.临床试验模式 3.前瞻性收集模式 理论基础 “银行”模式的组织库：按照一定的标准化运转程序（standard operating processeds, SOPs）规范人体组织的收集、加工和储存。 组织标本形式：通常为低温冷冻组织或蜡块。 缺点：不能提供新鲜的、未被冰冻的人体组织，亦不能提供某些有特殊加工需求的组织样本。不能满足研究者对组织块的个性化需求。 优点：可向研究者提供大量的组织样本，并且这些组织均有相关的临床信息和流行病学信息。 理论基础 临床试验模式：是”银行“模式的一个亚型，是由一个或多个临床试验收集的标本构成的标本库。 缺点：其内组织标本的应用受限于伦理委员会的要求，无法被广泛的应用与其他临床研究。同样，组织的大小、采集及加工的方法也不能满足所有研究者的需求。 理论基础 前瞻性收集模式：研究者指定需要的组织类型，同时也制定出所需的组织采集、处理及储存方法。 缺点：没有现成的大量的组织标本以及临床资料，因为组织需要前瞻性的去收集。 优点：研究者能获得他们需要的组织样本，能够满足其研究的个性化需求。 理论基础 二、组织收集 尽量缩短和记录手术摘除或从手术室转移到标本库的时间间隔很重要 Spruessel等人报道，组织离体后30分钟内称80%基因变化少于2个折叠[1] Maine等人报道，前列腺组织离体1小时内仅有不到1%基因发生了变化[2] 术后标本在体外保存5分钟和60分钟相比，其mRNA变化不明显[3] 1.Spruessel A, Steinmann G, Jung M, Lee SA, Carr T, Fentz AJ, Spangenberg J, Zornig C, Juhl HH, David KA. Tissue ischemia time affects gene and protein expression patterns within minutes following surgical tumor excision. Biotechniques. 2004;36(6):1030–1037. 2. Maine IP, Varambally S, Shen R, Chinnaiyan M, Rubin MA. Changes in differential gene expression because of warm ischemia time of radical prostatectomy specimens. Am J Pathol.2002;161(5):1743–1748. 3. Huang J, Qi R, Quackenbush J, Dauway E, Lazaridis E, Yeatman T. Effecs of ischemia on gene expression. J Surg Res. 2001;99:222–227. 理论基础 三、组织储存 北京大学季加孚等研究发现：手术后1 h内取材的组织经过3年低温保存，90％以上的标本仍有清晰的28S和18S RNA条带，提示RNA完整性较好[4] DNA分子稳定性较mRNA好，在-80℃环境中保存5年，DNA完整性良好[5] 4.季加孚．北京大学临床肿瘤学院肿瘤标本库的建设[J]．北京大学学报：医学版，2005，37(3)：329—330． 5.张佳年， 于颖彦， 计骏.等. 低温冻存时间对肿瘤组织生物大分子的影响[J]. 诊断学理论与实践 2009，V01．8，No1 材料与方法 肿瘤组织库库房，放置液氮罐、冰箱、冰柜等冷冻设备，用于存放标本；分子生物室（中心实验室）用于提取血清、血浆、分离淋巴细胞。 库房设备：液氮罐1个（YDS-30，沈阳新光）， -80℃立式超低温保存箱2台（DW-86L628，青岛海尔），4℃～-20℃冰柜1台（BCD-130Eb，青岛海尔）；联想电脑、条码扫描器、条码打印机1套（BP-IP300，德国BRADY）等。 库房 生物样本库资源信息管理系统 主要设备 BRADY条码打印机 液氮罐 海尔-80℃冰箱 患者入院后行生物安全性检查。检测HIV以及嗜肝病毒HBV及HCV感染情况。HIV感染患者不列为采集对象。HBV及HCV感染者需在标本上明确注明。 尊重患者的知情权和隐私权，在向患者及