《现代分子生物学》第八章 真核生物基因表达调控.ppt.ppt

* * * 七、基因表达与去甲基化的关系 DNA的甲基化也是真核生物转录调控的方式之一。启动子区的甲基化将抑制转录的发生。 甲基化可以在两个等位基因上发生。也可只发生在单个的等位基因上，这样就可造成来自父方和母方基因表达的差异。 * 甲基化对复制的影响： 原核细胞：甲基化影响显著，只有复制起点对称甲基化才能有效复制。 真核细胞：延迟从同一个复制起始位点开始的DNA复制再起始（reinitiatiing）；促进复制起始相关蛋白与相应DNA序列的结合；通过影响起始相关蛋白的表达，间接地影响复制的起始 。 * 甲基化显著抑制基因转录 甲基化DNA序列构型发生改变，影响相应转录因子对这段序列的识别和结合。； 识别、结合甲基化序列的蛋白质(包括MeCP1、2；MBD1、2等)与甲基化序列结合后，募集转录阻遏蛋白到局部，使局部组蛋白去乙酰化、染色质重构、异染色质化等； 识别、结合甲基化序列的蛋白质结合甲基化的启动子、增强子序列，干扰转录因子的活性 ； 甲基转移酶自身就可以与一些转录抑制蛋白相互作用，抑制基因转录 。 * 甲基化可以解释印记（imprinting)现象，印记描述了来自两个亲本的等位基因之间的行为差异。 甲基化发生在在特定的配子发生期间，并且是可逆的。目前已经在小鼠中发现了60多个发生甲基化的基因，大多与胚胎的发育生长有关。其中一些基因与早期胚胎发生相关，有的与胚后发育有关。 * * DNA的甲基化发生在特定位点上。动物细胞DNA的胞嘧啶2％－7％发生甲基化。大多数甲基化基因发生于CG联体。 甲基化基因没有激活，而未甲基化基因有表达活性。因此活性基因称为甲基化不足（undermethylation)基因。 * 甲基化是一个可逆的过程，去除甲基或添加甲基，可以特异性地重置基因的甲基化状态。甲基化模式的改变发生在胚胎发生时期。目前只确定了一种甲基酶可以将甲基添加到CpG对上。 适当的靶基因甲基化可以防止它们的不适当表达。 * 第三节 mRNA前体的可变剪接 一、可变剪接 mRNA前体通过不同方式的剪接，可由一个基因的转录产物产生出不同的成熟mRNA，从而翻译出不同的蛋白质的过程称为可变剪接（alternative splicing）或选择性剪接。 有些基因常不止一个转录起始位点，在不同的组织或不同的发育阶段由同一个基因转录出不同的mRNA前体，以不同的剪接方式产生有活性的蛋白质。 * * 二、可变剪接的调控机制 1．SR蛋白家族的调控 剪接体的形成与多种蛋白质和RNA复合体密切相关。在可变剪接上保守的SR磷蛋白家族因子的参与起重要作用。 SR蛋白家族以不同的质的组成与量的差异选择特定的mRNA前体剪接位点，不同的SR家族蛋白对适当的mRNA前体可以诱导出不同选择的剪接方式，在选择剪接上起决定作用。 * 2．RNP的调节 hnRNP-A1在不同组织中的含量变化很大，不参与组成性剪接。在选择5’和3’剪接点时具有可变剪接活性，成为参与可变剪接的调节因子，在体内与SR蛋白共同调节组织特异性的剪接。 U5hnRNP在酵母中参与5’剪接点突变的可变剪接。 * * 3．外显子限定模型 真核细胞mRNA前体中内含子远远大于外显子，5’与3’剪接位点可以跨越数万个核苷酸准确地组合在剪接体中。 有证据表明，在前速激肽原mRNA前体的可变剪接中，外显子下游的5’剪接位点可影响其上游内含子3’的剪接。 * Recent genome-wide analyses of alternative splicing indicate that 40–60% of human genes have alternativesplice forms, suggesting that alternative splicing is one of the most significant components of the functional complexity of the human genome. Here we review these recent results from bioinformatics studies, assess their reliability and consider the impact of alternative splicing on biological functions. Although the ‘big picture’ of alternative splicing that is emerging from genomics is exciting, there are many challenges. High-throughput experimen