生物信息学概述课件.pptVIP

收集资料;内容;定义;研究领域;研究方法;1.序列比对 序列比对（Sequence Alignment）的基本问题是比较两个或两个以上序列的相似性或不相似性。 我们一般借助与ncbi中的blast功能进行序列同源比对搜索;2.蛋白质结构预测与功能初步注释 基本问题是比较两个或两个以上蛋白质分子空间结构的相似性或不相似性。蛋白质的结构与功能是密切相关的。 我们借助计算机分析蛋白序列来预测蛋白质结构从而预测蛋白质的功能。一般认为，具有相似功能的蛋白质结构一般相似。 ;蛋白质序列结构信息;3.基因结构预测与基因表达分析 基因预测的基本分析内容 排除重复序列 确定开放阅读框（open reading frame, ORF）——内含子/外显子剪切位点识别；选择性剪切分析 确定基因的调控区——核心启动子/转录因子结合位点/转录启始位点的识别；转录终止信号的预测； CpG 岛的识别等 ;4.多序列联配及系统进化树构建 多序列对比： 通过计算机将多条氨基酸序列进行对比分析，可以得到以下信息： 1.同一基因或蛋白质在不同物种中的进化 2.多个基因或蛋白质序列之间的同源性确定它们在进化上的关系 3.基因或蛋白质的功能 系统进化树构建 通过序列同源性的比较进而了解基因的进化以及生物系统发生的内在规律 ;生物信息学与农业研究;生物学信息学在作物遗传育种研究领域中