data数据库搜索.ppt

* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * BLAST format options BLAST format options threshold score = 11 EVD parameters BLOSUM matrix Effective search space = mn = length of query x db length 10.0 is the E value gap penalties cut-off parameters 如何评价搜索结果的显著性 如何处理过多的结果 如何处理过少的结果 多结构域蛋白HIV-1 pol的BLAST 检索 BLAST 检索脂质运载蛋白 lipocalins :改变打分矩阵的作用 BLAST 搜索的一些策略 BLAST搜索策略总图. 视黄醇结合蛋白 如何评价搜索结果的显著性 同源性是基于由搜索结果的统计评估支持的序列相似性推出的。指认基因或蛋白质之间的相似性的问题不能单靠序列分析解决，还需要使用生物学上的标准来支持同源性的推导。可用对于蛋白的结构和功能的评估来补充BLAST的