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基于Image J软件肌原纤维蛋白SDS―PAGE优化
基于Image J软件肌原纤维蛋白SDS―PAGE优化
摘要:采用浓缩胶浓度为5%,分离胶浓度为12%的SDS凝胶系统,运用Image J软件分析不同蛋白质浓度、pH、NaCl浓度对肌原纤维蛋白的分离效果。结果表明,在蛋白质浓度为1.2 mg/mL、pH为7.5、NaCl浓度为0.5 mol/L时,肌原纤维蛋白中各蛋白质及其亚基实现较好分离,均匀分布于整个电泳条带,且各蛋白条带光密度值能清晰分辨。Image J软件能有效地应用于SDS图像分析。
关键词:肌原纤维蛋白;SDS;Image J软件
中图分类号:TS254.1 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2017)24-4839-05
Image J软件是由National Institutes of Health开发的基于Java的图像处理软件,可计算选定区域内分析对象的一系列几何特征。现已广泛应用于植物叶片形态特征描述[1]、金属显微定量分析[2]、针织物孔隙率统计[3]、淀粉表面几何特征分析[4]等场景。目前,Image J软件在电泳图像分析中也有应用,可将蛋白条带数据进行量化,转化为光密度值,解决了肉眼观察的不确定性问题[5]。十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS)作为一种快速、经济、可重复的蛋白质定性、定量分析及特征鉴定的方法,已广泛应用于各种畜禽肉[6]、水产品[7]、水稻[8]、大豆[9]等农产品蛋白质的分析检测。采用条件适宜的缓冲溶液稀释提取的样品蛋白,并制备电泳样品,利用SDS中网状结构聚丙烯酰胺凝胶所具有的分子筛效应,将不同分子量的蛋白质及其亚基进行分离,从而达到分辨蛋白质的目的。但对于一些极端条件下的样品蛋白,如高NaCl浓度的酱油发酵液、蛋白酶解液等,不能直接运用SDS手段进行分析检测。因此,本试验对肌原纤维蛋白在不同溶液环境(蛋白质浓度、pH和NaCl浓度)条件下进行SDS,采用Image J软件对电泳图像进行数据量化,综合光密度值指标,得到适宜的溶液环境条件范围,为极端条件下的SDS的样品准备提供参考依据。
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
1 500 g左右的新鲜健康草鱼(Ctenopharyngodon idellus),购于湖北省武汉市武商量贩农科城店。30 min内低温运送到实验室用于提取肌原纤维蛋白。
磷酸、盐酸、氯化钠、十二烷基硫酸钠、甲醛、冰乙酸、氯化镁、考马斯亮蓝R-250、G-250,国药集团化学试剂有限公司;过硫酸铵、30%丙烯酰胺Acr-Bis、蛋白上样液、电泳缓冲液、1.5 mol/L Tirs-HCl,武汉科瑞生物技术有限公司;Pre-stained Protein Marker,天根生化科技有限公司(11-245 kDa);EGTA,美??Biosharp公司;Tris-BASE、0.5M Tris-HCl,美国Dow Chemical公司;四甲基乙二胺(TEMED),美国MYM公司。
1.2 仪器与设备
F050A片冰机,福建雪人股份有限公司;GL-21M离心机、HI650R离心机,湖南湘仪实验仪器开发有限公司;722N可见分光光度计,上海仪电分析仪器有限公司;PB-10 Sartorius pH计,德国Sartorius公司;T18高速均质机,德国IKA公司;DYY-12型电泳仪电源、24DN制胶器、电泳槽、WD-9406型胶片观察灯,北京市六一仪器厂;Universal Hood Ⅱ凝胶拍照系统,美国Bio-Rad公司;SHA-C恒温振荡器,常州国华电器有限公司。
1.3 试验方法
1.3.1 提取肌原纤维蛋白 参照Wu等[10]的方法,取新鲜草鱼背部肌肉45 g,切碎,加入4倍体积的分离缓冲溶液(0.1 mol/L NaCl,10 mmol/L H3PO4,2 mmol/L MgCl2,1 mmol/L EGTA,pH 7.0)高速匀浆30 s后,低温离心(2 000 g,15 min,4 ℃),重复操作2次;取沉淀再用4倍体积0.1 mol/L NaCl溶液高速匀浆30 s,低温离心(2 000 g,15 min,4 ℃),重复操作1次,得到的沉淀即为肌原纤维蛋白,保存于 4 ℃冰箱,48 h内可用。蛋白质浓度采用考马斯亮蓝法[11]测定。
1.3.2 制备电泳样品 不同蛋白质浓度:采用Tris-HCl缓冲液(0.5 mol/L NaCl,pH 7.5)对肌原纤维蛋白进行稀释,获得终浓度为0.3、0.6、0.9、1.2、1.5、1.8 mg/mL的蛋白质溶液。
不同pH:采用20 mmol/L Tris-HCl缓冲液(含0.5 mol/L NaCl)调节肌原纤维蛋白浓度至1.2 mg/mL,然后采用1 mo
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