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基于VB技术基因数据检测大数据管理

基于VB技术基因数据检测大数据管理   摘 要:人类将可以预测在未来患某种疾病的风险,这将使人类受益无穷,甚至彻底改变人们的生活方式。然而由于基因测序的数据非常复杂,且数据量庞大,每个人的基因数据都是独一无二的,使基因检测在临床应用中管理难度较大,设计针对基因检测在临床中应用的检测系统,有效的管理了临床中基因检测的信息,大大减小了人工管理的成本。此系统不仅可以连接控制检测设备和基因病例分析系统,还可协助医生对检测结果进行分析和判断辅助,使医生对一些先天疾病的诊断和尚未发病的疾病的预测。该系统使用SQL Server 2005数据库,前端开发工具使用Visual Basic.NET,数据库访问采用了.NET框架下的ADO.NET技术。该系统的前端基于Windows系统设计实现了检测信息查询、查询重置、启动检测、检测信息处理、突变位点比对分析、检测结果查询和大数据管理与分析等功能。   关键词:基因检测 Visual Basic 数据库 ADO.NET技术   中图分类号TM7 文献标识:A   1 引言   目前,相关基因数据检测系统研发的匮乏给医院普及基因检测项目造成了一定的阻碍,加之基因检测高昂的费用,所以基因检测在民众中还尚未得到普及。基因检测在人类诊断医学领域也做出了贡献,我国在国际上率先发现了遗传性耳聋的基因,生物芯片的研发也逐步进入产业化阶段,正在与国际先进技术接轨。为了方便基因检测技术的推广,使基因检测技术逐步与国际接轨,方便基因检测数据的管理,提高检测的效率,使基因检测项目能在大中型医院率先得到普及,本文讲述了开发基因数据检测系统的过程,详述了开发该系统所需的技术和相关原理,研究思路,更好地普及基因检测技术。   2 基因检测技术   基因检测技术是生物技术、计算机科学和基因组测序等学科的融合的产物,已经使现代医学的研究发生了前所未有的变化,基因组学和信息学作为医学研究的基础工具,在生物学研究中发挥了异常重要的作用,基因检测技术的发展,对于临床医学领域同样起到不小的作用,经常被用于辅助诊断和指导合理治疗。   3 系统流程分析   基因数据检测系统操作流程进行分析,首先要进行用户登录,用户输入用户名和对应密码,系统先从数据库用户信息中搜索用户名信息,若无输入的用户名则弹出提示框,显示用户密码不存在,用户点击确定后需要重新输入用户名信息,若从数据库中找到输入的用户名信息,则系统再从数据库中检索与该用户名一一对应的密码信息,并且将此正确密码与用户输入的密码进行比对,若两者不相同则弹出提示框,警告用户密码错误,用户重新输入用户名和密码,若密码与用户名匹配,则进入基因检测系统操作界面。   3.1数据流分析   3.2相关基因及突变位点信息检测   每一个相关基因都对应这不同的信息,所以要将基因数据单独做成表格,每一个信息都对应着自己的突变位点名称,由于同一个基因的突变位点不唯一,所以将建立四个对应的突变位点,分别作为四个突变位点字段,突变位点1、突变位点2、突变位点3、突变位点4,由于日常用于检测的单个基因易发生突变的位点数不超过四个,所以设置成4个突变位点字段,如果以后出现增加情况可以通过数据库直接增加字段,这样不会影响到整个系统的可扩展性。另外每个相关基因都对应着不同的病症,需设置病症字段用来存储此数据。   4. 系统功能设计   本系统基本满足医院日常检测的需求,功能分为:系统登录功能、患者信息查询功能、查询重置功能、检测功能、检测信息处理功能、突变位点信息比对、打印检测结果功能、检测结果查询功能。   4.1系统设计与实现   本系统的系统架构由二部分组成。 基因数据检测系统的主界面如图显示,上设置有查询按钮,重置按钮,界面上方用8个文本款显示患者的基本信息,界面中部用几个文本框组成一个类表格,用来显示患者检测项目所对应的相关基因,突变位点和芯片编号,检测项目单独在页面左侧显示,页面左下角有开始与退出两个按钮供用户选择下部操作。   4.2大数据检测与分析   数据检测结果显示界面,将检测到的图像返回后显示在左侧图片框内,其余数据正常显示,然后在没个突变位点后面显示分析后的结果,如果该位点发生了突变则输出+,以示检测结果为阳性,若为检测到突变则数出“未检测到异常突变”。界面左下角有打印与返回按钮,可供用户选择打印结果的纸质报告,还是返回继续基因数据检测。这样可以将多次检测结果,导入大数据管理与分析功能模块得出最终的分析结果。   5 总结   本文设计主要针对医院以及专业基因检测机构的基因检测管理而设计,极大的方便了基因数据检测数据的处理与管理,一定程度上解决了人工管理带来的误操作增加、检测效率低下等问题,给基因检测的普及带来了可能性。本系统基于Visual Basi

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