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基于本体疾病知识库系统构建研究 　　[摘要]本文从本体的角度探讨了疾病知识库系统的构建，该系统能够从语义层面实现异构疾病相关信息之间的互操作，对有效提升医学领域的知识服务水平，方便医技学者管理和利用海量的疾病信息，发挥疾病信息的巨大价值具有重要现实意义。 　　[关键词]本体　疾病知识库　系统构建 　　 　　随着医学的发展，医学信息与日俱增，如何从海量的医学信息中发现新的医学规律及潜在的疾病诊治关联，实现医学信息广泛共享，是进行医学信息管理的关键。基于本体构建疾病知识库系统，对于提供临床决策支持、挖掘医学信息最大潜力、提高我国医疗卫生水平等方面均有重要意义。 　　 　　1　本体概述 　　 　　本体最初是一个哲学上的概念，指关于客观存在及其本质和规律的学科。本体理论是关于客观世界某个方面的特定分类体系，这个体系不依赖于特定的描述语言。1986年之后，本体逐渐被其他领域所应用，用于精确表示知识及知识问的联系，实现知识的共享与重用。 　　随着研究的深入，人们对本体内涵的认识逐渐加深，对于本体的定义也不断变化，其中最为流行的是Gruber提出的“本体是概念模型的一个明确的规范说明”和Studer提出的“本体是可共享的概念化模型的一个明确规范说明”，包含了“概念化、共享、形式化、规范化”4层含义(An ontology is aformal，explicit specification nf a shared conceptualisation)。 　　虽然研究者对于本体的定义不同，但对其内涵认识是一致的，即本体是关于某一领域知识的明确的概念集，包括概念及概念之间的关系，能从语义和知识层面上对客观事物进行描述。本体提供了一种人与人之间、人与机器之间、机器与机器之间进行交流的共享基础，可以解决通信、异构环境互操作和系统工程中的知识重用、知识获取、系统集成等问题，有助于实现相关学科领域知识标准化的建设问题。由于本体强大的知识表示功能及普遍适应性，目前本体理论已被广泛应用到知识工程、人工智能、图书情报、数字图书馆等多个领域，促进了相关学科的研究与发展。 　　 　　2　疾病知识库简介 　　 　　疾病知识库是各种疾病症状、诊断、治疗等相关知识的集合，用来存储临床医学知识及医务工作者的临床经验。疾病知识库中存储大量成功疾病诊治案例，可以为临床医生进行临床决策、医学院校进行案例教学、患者及普通人了解疾患知识、普及健康知识等提供知识支持，在准确诊治、规范用药等方面起到重要参考作用，防止人为造成的疾病无法医治现象(如最近超级病菌病例的出现)的发生。 　　基于本体思想及技术对各种疾病知识进行整合描述，能够清晰揭示出各种疾病、机体、药物等之间的关系，较好地在语义层次上解决医学知识整合问题。构建基于本体的疾病知识库，有助于学习疾病知识并发现疾病知识之间潜在的关联及深层规律，为医学发现提供强大的知识服务。 　　 　　3　基于本体的疾病知识库系统的设计 　　 　　基于本体构建疾病知识库，能够解决大量复杂医学数据管理、数据语义描述、数据共享问题，根据实际情况选择恰当的本体工具进行系统设计。 　　 　　3.1系统体系结构 　　根据层次结构思想，我们将基于本体的疾病知识库系统模型的基本框架分为二层：用户应用层、语义网络层、本体数据层。 　　用户应用层主要提供用户需求查询接口，用户利用接口通过语义网络层和语义处理来访问本体数据层。 　　语义网络层包括语义描述与分析组件、推理机及资源管理组件，提供信息的语义描述与转换，对用户信息需求进行形式化转换，与本体知识库数据进行链接，对疾病本体知识库中的数据进行管理。 　　本体数据层包括疾病本体知识库和辅助资源库，通过知识抽取工具从电子病历、各种数据库、书刊资料以及Web网络资源等信息源提取与疾病相关的信息，经过主体规范与分析构建将概念、关系存入疾病本体知识库，将推理构建规则、管理数据等存入辅助资源库，提供共享数据的基础。 　　 　　3.2疾病本体知识库的构建 　　疾病本体知识库构建最主要的是要建立医学疾病概念词典，包括疾病名称、症状、患者信息、诊疗手段、药物、各类辅助检查方法、治疗效果、致病原因分析等信息，其中疾病名称、症状、诊疗手段、各类辅助检查方法等可以借助已有词表或系统，如UMLS、ICD-10、《中华人民共和国国家标准一疾病分类与代码》、《中国药品通用名称》、《临床疾病与手术术语集》等，已有词表中只是规范了相应概念的标准术语，UMLS虽然也提供了一种疾病的表示方法，但在构建时由于最大限度整合已存医学概念，造成一些无法克服的不足，如概念冗余、概念与语义网不一致等现象，利用本体理论与思想构建疾病本体知识库可以解决这些现象，利用本体方法进行类与关系描述，深层次揭示各种概念之间