基于随机森林算法川芎成分―靶点―疾病网络预测研究.docVIP

基于随机森林算法川芎成分―靶点―疾病网络预测研究 　　[摘要] 该研究搜集KEGG数据库中小分子药物及其酶、离子通道、G蛋白、核蛋白等4类药靶数据作为训练集，建立基于随机森林法的药物-靶点相互作用模型；采用十折交叉验证评价模型精度，获得4类药靶模型的预测正确率分别为71.34%，67.08%，73.17%，67.83%。利用该模型对川芎26个化学成分进行靶点预测，并构建其成分-靶点-疾病网络，所得结果得到了较好的文献验证。该文所建模型具有较高的预测精度，可用于发现其他中药成分的潜在作用靶点。 　　[关键词] 网络药理学；靶点预测；川芎；心脑血管疾病 　　川芎为伞形科植物川芎Ligusticum chuanxiong Hort.的干燥根茎，具活血行气、祛风止痛的功效，对心脑血管系统、神经系统等疾病有独特的疗效[1]，但其药理作用分子机制尚不明确。中药网络药理学研究立足于中药已知化学成分及相关疾病靶标，用计算方法研究中药化学成分的多靶标、多途径协同作用，并用网络拓扑图的形式直观呈现[2]。中药网络药理学初步揭示中药成分复杂作用机制，将中药作用机制研究推进到分子水平[3]，为开发现代中药奠定方法学基础。本文以川芎为研究对象，运用网络药理学方法，研究川芎“成分-靶点-心脑血管相关疾病”复杂网络，从网络药理学角度阐释川芎治疗心脑血管类疾病的有效成分及其潜在靶点，为开发更好的心脑血管类