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第三章2转录的延伸、终止及RNA的加工

一、转录的延伸 RNA链延伸的基本过程 RNA链延伸的暂停 RNA链延伸的再次启动 RNA链延伸的基本过程 核苷酸加到RNA链的3′-OH上,RNA链延长。 RNA链延伸的暂停 链延伸的速度不是恒定的,在DNA的某些区域,转录速度减慢或停止,常发生在富含GC区。 1、转录终止概述 终止时,核苷酸不再添加到延伸的RNA链上,开放三元复合物解体。 终止可能既需识别终止序列,也需RNA产物的发夹结构。 2、大肠杆菌的两类终止子 终止子(terminator) 不依赖ρ因子的终止(Rho-independent) 无其他因子参与,核心酶能在某些位点终止转录。 依赖ρ因子的终止 (Rho-dependent) 终止子结构 1) 二级结构中的发夹(长度7-20 bp) 靠近基部通常有一个G-C富集区。 2) 转录单位最末端对应的DNA有连续4-8个A组成的片段。 在大肠杆菌基因组中,符合这些标准的序列约有1100个,这暗示了约一半基因拥有不依赖ρ因子的终止子。 ② ρ因子的作用机理 三、真核生物RNA转录的终止 (1) RNA聚合酶Ⅰ在18个碱基形成的终止子序列处终止转录; 五、原核生物与真核生物mRNA 的特征比较 1、转录发生的部位 细菌mRNA的转录和翻译发生在同一细胞空间;转录、翻译、降解间隔时间很短,或者几乎同步进行。 真核生物mRNA合成与成熟完全在细胞核内发生,而翻译在细胞质中完成;其转录、翻译、降解三者间间隔时间较长。 原核生物mRNA (1) 许多是以多顺反子形式存在; (2) 5′端无帽子结构; (3) 3′端没有或只有较短的poly(A)。 起始密码AUG上游7-12个核苷酸处有一被称为SD (Shine-Dalgarno sequence)的保守区,与16S rRNA 3′端保守核苷酸反向互补。 rRNA保守区:3′-UCCUCC-5′ 真核生物mRNA结构特征 5′ Gppp+pppApNpNp … 5′GpppApNpNp…+PP+P mRNA 5′末端帽子特征的生物学功能: I: 使mRNA免遭核酸酶的破坏,保持其结构的稳定性; II: 有利于蛋白质合成起始因子的识别,从而促进翻译的起始。 高等真核生物(除组蛋白基因)的mRNA, 3′端具有poly(A)尾巴,长度40-200 bp。 应用二: 可设计寡聚Oligo (dT)片段合成cDNA (4) 真核生物mRNA中常含有内含子 3. 生命周期 原核生物mRNA寿命较短,通常只能翻译几分钟; 真核生物mRNA寿命较长,可持续翻译几小时。 (一)tRNA的加工 (二)rRNA的加工 (三)mRNA的加工 (一)tRNA的加工 1. 原核生物tRNA的加工 参与蛋白质合成的tRNA不是最初的转录产物 (1) 它们的5′端都是单磷酸,而原始的转 录产物5′应是三磷酸; (2) 最终的tRNA分子比初始转录物小; (3) tRNA含有特殊的碱基,这些碱基是通过一些化学修饰产生的。 tRNA加工时需要多种核酸酶参与: 如:RNase D、E、F和P等,RNaseP主要在tRNA的5′起作用。它由蛋白质和RNA组成,它不识别特殊序列,只识别二级结构。 RNaseD主要负责切除3′序列。 tRNA核苷酸转移酶,催化3′末端的CCA的生成。 缺-CCA的tRNA要用tRNA核酸转移酶加-CCA。 (5) 修饰:通过甲基化酶,硫醇酶,假 尿嘧啶核苷化酶等进行修饰,如氨 基酸臂的4-硫尿苷,D臂的2甲基鸟苷,TψC臂的假尿 苷(ψ)和反密码子环上的2异戊 腺苷。 2. 真核的tRNA的加工 真核tRNA的基因和原核生物的异同: (1)真核的前体分子tRNA是单顺反子,但成 簇排列,基因间有间隔区; (2)真核tRNA基因一般都比原核tRNA基因多 得多,如酵母约有400个tRNA基因; (3)增加了剪接内含子的过程。 (4)都要加CCA。 (二)rRNA的加工 1. 原核rRNA的加工 大肠杆菌中具有7个编码rRNA的操纵子; 原初转录物30S,由5S、16S、23S rRNA和一些 tRNA构成; Rnase III 参与rRNA加工。 2.真核生物rRNA的加工 45S 前体rRNA形成后立刻与蛋白质结合,加工发生在核糖体上,而不是游离的rRNA上。 (1) 切除5′端的前导序列; (2) 从45S的中间产物中先切下18S的片段。 mRNA前体分子的加工主要是真核mRNA,原核的mRNA

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