我国北部湾部分海产品中副溶血弧菌基因分型研究.docVIP

我国北部湾部分海产品中副溶血弧菌基因分型研究 　　摘要利用RAPD技术对北部湾分离的24株Vp进行基因分型。结果显示：RAPD可以分离出7~11条不同的条带，大小0.45~1.50 kb。聚类分析结果表明在相似度为0.84时，RAPD分辨力指数为0.931。采用通过POPGENE 32软件对比了24株Vp的各种遗传参数，结果表明：RAPD的Shannon信息指数、有效等位基因数、Nei基因多样性分别为0.561 6、1.681 6和0.382 3。表明RAPD能较好地研究Vp的分子遗传特征，适合于区分不同来源的Vp菌株。 　　关键词海产品；副溶血弧菌；基因分型；RAPD；聚类分析；北部湾 　　中图分类号Q789文献标识码A文章编号 1007-5739（2014）11-0273-02 　　 　　ResearchonGenotypingofVibrioparahaemolyticusinSeafoodinPartofChineseBeibuGulf 　　WEI Qiang 1LI Yi-cai 2 　　（1 Luobu Town Yufeng District Aquatic Animal Husbandry and Veterinary Station of Liuzhou City in Guangxi Zhuang Autonomous Region 545011； 　　2 Laibin Animal Product Quality and Safety Testing Center） 　　AbstractGenotyping 24 strains of Vp from Beibu Gulf were conducted using RAPD. The results showed that RAPD yielded 7 to 11 distinct bands with the size range between 0.45 kb and 1.50 kb. Cluster analysis showed that with the coefficient more than 0.84，RAPD resolution index was 0.931. Using POPGENE 32 software compared to the parameters of various genetic 24 strains of Vp，results showed that the Shannon information index（I），effective number of alleles per locus（Ne），Nei′s gene diversity index（H）of RAPD were 0.561 6，1.681 6 and 0.382 3，respectively. The results showed that the RAPD method was sensitive to distinguish reflect the molecular genetic characteristics Vp strains. 　　Key wordsseafood；Vibrio parahaemolyticus；genotype；RAPD；clustering analysis；Beibu Gulf 　　 　　副溶血弧菌（Vibrio parahaemolyticus，Vp）的传统分型方法是血清分型，主要是利用菌体的O抗原和荚膜的K抗原对细菌进行区分。但是该方法也存在不少缺点：分辨力有限，且人为因素干扰严重，尤其在突发公共卫生事件需要病原进行溯源时难以满足准确、快速追踪的需求。随着分子生物学技术的发展，基因分型技术已越来越广泛的应用于病源微生物的检测和流行病学的研究中。用分子分型技术从分子水平上研究Vp的变化情况，能更好地了解不同地区Vp之间的亲缘关系以及遗传关系变化情况，也有利于追踪Vp感染的源头，从而更好地预防和控制Vp引起的食物中毒等事件的发生[1]。 　　通过从我国北部湾4个海区不同采样点采集的不同贝类样品中分离的Vp，利用RAPD方法，分析了不同来源菌株间的种类、遗传参数，比较了Vp菌株的指纹图谱的相似度，以便了解不同地区贝类产品中不同菌株的遗传变异程度和考察菌株间的差异和地理来源的关系。以此为基础探讨RAPD分型技术的优缺点，为深入了解Vp的分子生物学特征提供技术参考。 　　1 材料与方法 　　1.1试验材料 　　1.1.1菌株来源。分别从我国北部湾湛江港、防城港，钦州港和北海港采集贝类样品（牡蛎、扇贝、菲律宾蛤仔、毛蚶、贻贝、缢蛏），并分离菌株，采用MPN-PCR[2]方法检测，