第十章微生物分类与鉴定Microbial taxonom.docVIP

第十章 微生物分类与鉴定 Microbial taxonom 1. 本章内容提要与学时分配（2学时） 通用分类单元；微生物分类鉴定的方法；各大类微生物的分类系统纲要；微生物在自然界的地位。 2. 教学提示 本章重点在于让学生了解微生物的分类单位和命名方法、微生物的分类及鉴定方法。 3. 本章目的与要求 1）理解通用分类单元(界→菌株)与双名法； 2）熟悉微生物在生物界的地位(两界→六界系统，三域系统)； 3) 了解微生物的分类系统； 4）掌握微生物的分类鉴定方法与常见种学名。 4. 作业(见课件) 分类主要是探索生物之间的亲缘关系，把它们归纳为互相联系的不同类群。具体任务就是分类、鉴定和命名。 一、分类单位与命名 （一）分类单位:　　界,门,纲,目,科,属,种　　种是最基本的分类单位,它是一大群表型特征高度相似，亲缘关系极其相近，与同属内其它种有着明显差异的菌株的总称。　　种以下又分亚种(变种),型,类群,菌株(品系)　　菌株(品系)(strain): 表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖成的纯种群体及其一切后代。（二）命名　　命名按照《国际细菌命名法规》,采用林奈氏双名法。　　属名 + 种名 +命名人　　如大肠杆菌: Escherichia coli (Migula) Castellani Chalmers 1919　　属名:名词,大写首字母,一般描绘主要形态或生理特征。　　种名:形容词,小写,代表一个种次要特征。　　未确定种名或不指特定的种时，可在属名后加sp.表示。　　举例　　　　 真菌界 Fungi　　　　 真菌门 Eumycophyta　　　　 子囊菌纲 Ascomycetes　　　　 原子囊亚纲 Protoascomycetes　　　　 内孢霉目 Endomycetales　　　　 内孢霉科 Endomycetaceae　　　　 酵母亚科 Sacchromycetoideae　　　　 酵母属 Sacchromyces　　　　 酿酒酵母 S. cerevisiae Hansen 二、分类依据　　1、形态特征（个体和群体） 　　　细胞形态：形状、大小、排列、染色反应等。　　　培养：固体- 菌落，半固体- 穿刺，液体。　　2、生理生化反应　　　营养要求：碳源、氮源、营养类型　　　代谢产物：种类、产量、显色反应　　　酶：产酶种类、反应特性　　3、生态学特征　　　相互关系、宿主种类、与氧关系等。　 4、生活史　 5、血清学反应　　　近年又发展了红外光谱，GC含量，DNA杂交等。三、分类方法　（一）经典分类法　随机地和不系统地根据一些特征进行分类。主要是形态、生理生化特征。　（二）数值分类法 根据较多特征分类，每一特征地位相同。　1、每一菌株为一操作单位，确定很多特征（50-60 个）　2、比较菌株间的最大相似性　　阳性和阴性符合的总和　　--------------------------------× 100%　 总的测定数 --- 无效测定数　 85%为同种，65%为同属　3、据数值绘出矩阵图并转换成树状谱。 （三）分子与遗传方法　　1、DNA碱基组成：GC%　　　相同不能说明是同种，但不同则肯定不是同种。 　　　差别10%不是同种，10%可能是同种。　　2、核酸分子杂交　　　比较碱基顺序的同源性　　3、16s rRNA寡核苷酸编目分析　　　水解rRNA产生一系列寡核苷酸片段，顺序分析。　　　近年来，采用红外、核磁、电镜等新技术越来越广泛。四、分类系统　　原核生物：　　　《伯杰氏细菌鉴定手册》第8版，1973　　　《伯杰氏系统细菌学手册》第9版，1984　　真菌：Ainsworth (1973)系统　　酵母：Lodder分类系统　　菌种鉴定工作三部曲　　　　 1、获得该微生物的纯培养　　　　 2、测定一系列必要的鉴定指标　　　　 3、查找权威性鉴定手册  第十一章 微生物的应用与微生物学研究进展（自学） 1. 本章内容提要与学时分配（2学时） 微生物在工业生产中的应用；微生物在农业生产中的应用；微生物在医药中的应用；微生物学研究进展。 2. 教学提示 本章重点是让学生熟悉微生物在工业、农业与医药等领域中的应用（参见沈萍《微生物学》）以及为生物学研究的最新进展或信息。 3. 本章目的与要求 熟悉微生物在工业、农业与医学等领域的应用，查阅微生物学研究进展论文，每人写一篇读书报告，班级交流。 4. 作业(见课件)