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生物化学-王镜岩-第三章-氨基酸课件

第二章 氨基酸 Chapter2 Amino acid 教学目标: 掌握氨基酸的结构特点与理化性质。 1.从氨基酸的结构特点上理解氨基酸的分类和生物学特性。 2.掌握氨基酸的理化性质,重点掌握两性解离与等电点的含义、氨基酸参加的化学反应,特别是侧链的反应。了解氨基酸的光谱学特征。 第一节 氨基酸 (Amino acid,AA) —蛋白质的构件分子 Protein Architecture P123 一 蛋白质的水解 酸水解: 6mol/L HCL,4mol/L H2SO4 回流煮沸20h。 缺点:Trp破坏,Asn、Gln脱酰胺基, 羟基氨基酸(Ser Thr)部分破坏。 优点:不消旋 碱水解:5mol/LNaOH共煮10-20小时 缺点: 消旋 优点:色氨酸稳定 酶水解:水解位点特异,得到多肽片段和AA的 混合物,用于一级结构分析。 二. 氨基酸的结构 (Structure of Pr-AA) 1. 20种氨基酸的结构通式: 2.结构特点 (1)除脯氨酸(亚氨基酸)外,这些天然氨基酸在结构上 的共同特点为: 与羧基相邻的α-碳原子上都有一个氨基,因而称为α-氨基酸. ----C-C-C-C-COOH γβα ----C-C-C-C(NH2)-COOH α-氨基酸 ----C-C-C(NH2)-C-COOH β-氨基酸 ----C-C(NH2)-C-C-COOH γ-氨基酸 (2)除甘氨酸外,其它所有氨基酸分子中的α-碳原子都为不对称碳原子,所以: A.除甘氨酸外都具有旋光性.除甘氨酸 外,都具有D-型 和L-型两种立体异 构体。 B. 除胱氨酸和酪氨酸外,其余AA都能 溶于水。 三. 氨基酸的分类 AA and classification 基本氨基酸:编码的蛋白质氨基酸 20种 修饰(稀有)氨基酸:多肽合成后由基 本aa经酶促修饰而来。 存在于生物体内但不 组成蛋白质 (约150种)。 1.脂肪族氨基酸 (1).中性氨基酸:含一氨基一羧基 Gly Ala Val Leu Ile Ser、Thr Cys、Met 含有羟基和硫的氨基酸 含羟基:Ser、Thr 含硫:Cys、Met 含羟基的氨基酸:Ser、Thr ★ Ser的-OH(PKa=15),在生理条件下不解离, 但它是一个极性基团,能与其它基团形成 氢键,具有重要的生理意义,常出现在 大多数酶的活性中心。 ★ Thr 中的-OH是仲醇,具有亲水性。 ★ Ser和Thr的-OH往往与糖链相连,通过O- 糖苷键形成糖蛋白。 ★Cys的R中含巯基-SH,具有两个重要性质: (1)在较高pH值条件,巯基离解。 (2)两个Cys的巯基氧化生成二硫键,生 成胱氨酸。Cys—s—s—Cys ★二硫键在蛋白质的结构中具有重要意义。 Cys还常出现在酶的活性中心。 ★Met的R基中含有甲硫基(-S-CH3),硫原 子有亲核性,易发生极化,因此,在生物合成中是一种重要的甲基供体。 (2)酸性氨基酸及其酰胺: Asp、Glu、Gln、Asn 酸性氨基酸及其酰胺: Asp、Glu、Gln、Asn (3).含碱性基团: His 、Lys 、Arg Lys侧链氨基的pKa为10.53,生理条件下,Lys 侧链带有一个正电荷(NH3+). Arg是碱性最强的氨基酸,侧链上的胍基是已 知碱性最强的有机碱,pKa值为12.48,生 理条件下完全质子化。 His含咪唑环,它是20种氨基酸中侧链pK值最 接近生理pH值的一种,在接近中性pH时, 可离解平衡。它是在生理pH条件下唯一具 有缓冲能力的氨基酸。 (2).芳香族氨基酸:Phe、Tyr 、Trp 这三种氨基酸在紫外区280nm处有特殊吸收峰,蛋白质的紫外吸收主要来自这三种氨基酸,在280nm处,三种氨基酸的紫外吸收值 Trp>Tyr>Phe

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