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第5章 蛋白质的三维结构 3-dimensional structure of proteins X-ray studies 5.2.1 氢键 Hydrogen bonds 氢键： 连在电负性强的半径小的原子上的氢原子与另一个电负性强的原子之间的相互作用。 x H···y x，y 的特点：?电负性强；?分子半径小；?有孤对电子 代表: N，O，S原子等 5.2.2范德华力van der Waals force 广义的范德华力包括三种弱的作用力： ?定向效应 ?诱导效应 ?分散效应 Hydrophobic interaction in proteins: Hydrophobic interactions are clearly important in stabilizing a protein conformation; The interior of a protein is generally a densely packed core of hydrophobic amino acid side chains. Ionic interactions 生理pH下，Asp、Glu侧链解离成负离子，Lys、Arg、His侧链解离成正离子 多数情况下，这些基团