西农萨能羊乳腺脂肪酸合酶基因exon9-15的克隆与序列-CiteSeerX.PDFVIP

中国农业科学 2008,41(3):828-833 Scientia Agricultura Sinica 西农萨能羊乳腺脂肪酸合酶基因exon 9-15 的克隆与序列分析 王海滨，罗 军，武会娟，韩雪峰，单翠燕，张 宁 （西北农林科技大学动物科技学院，陕西杨凌 712100 ） 摘要： 【目的】山羊FAS 基因 exon 9-15 编码的乙酰/丙二酸单酰基转移酶（acetyl-CoA and malonyl-CoA transacylases,AT/MT）区域对山羊乳短、中链脂肪酸的合成起重要调控作用。本研究针对西农萨能羊乳腺 FAS 基 因exon 9-15进行克隆和序列分析。【方法】以处于泌乳期28 d的西农萨能羊乳腺组织mRNA反转录的cDNA为模 板，通过RT-PCR方法首次扩增出西农萨能羊乳腺 FAS 基因exon 9-15的cDNA序列全长及exon 8 的3′端和exon 16 的5′端部分cDNA序列（GenBank收录号为DQ 915966），并对其进行了同源性分析和功能预测。【结果】克 隆片段全长 1 449 bp，其中包括 exon 9-15 共 1 388 bp、exon 8 的 3′端 9 bp 和 exon 16 的 5′端 52 bp，编 码 483 个氨基酸，包含编码的 AT/MT 区域 951 bp（454～1404 nt）；西农萨能羊乳腺 FAS 基因 exon 9-15 与牛 （NM_001012669），人（NM_004104），大鼠（NM_017332）和鸡（NM_205155）核苷酸序列相似度分别为95%、85.7%、 82.7%、73.2%，氨基酸相似度分别为 92.9%、77.7%、82.3%、64.7%；exon 10 较其它物种缺失 1 个氨基酸。【结 论】克隆获得西农萨能羊 FAS 基因片段全长 1 449 bp，外显子 9-15 大小分别为 463、185、190、95、135、204 和 116 bp；核苷酸及氨基酸序列与牛相应序列的同源性均高于其它物种；AT/MT 区域的活性位点在各物种间均为 高度保守的丝氨酸，但西农萨能羊 exon 10 较其它物种缺失 1 个氨基酸，这可能对 AT/MT 区域的空间构象及其生 理功能产生重要影响。本研究为西农萨能羊 FAS 基因cDNA全长克隆以及基因功能研究奠定了重要基础。 关键词：山羊；乳腺组织；脂肪酸合酶基因；exon 9-15 Cloning and Sequence Analysis on exon 9-15 of FAS Gene in Mammary Gland of Xinong Saanen Goat WANG Hai-bin, LUO Jun, WU Hui-juan, HAN Xue-feng, SHAN Cui-yan, ZHANG Ning (College of Animal Science and Technology, Northwest Agriculture and Forest University, Yangling 712100, Shaanxi) Abstract: 【Objective 】The acetyl-CoA and malonyl-CoA transacylases region encoded by exon 9-15 of goat FAS gene plays a central role in synthesis of short- and medium-chain fatty acids in goat milk. In this work, exon 9-15 of Xinong Saanen goat mammary gland FAS gene was cloned and sequenced. 【Method 】 The mRNA from Xinong Saa