结直肠癌单核苷酸多态性的研究进展.docVIP

结直肠癌单核苷酸多态性的研究进展 　　【摘要】 结直肠癌作为一类比较常见的消化系统疾病越来越受到医生重视，本文总结结直肠癌单核苷酸多态性的研究进展，为以后的工作明确研究方向，但是鉴于人体基因的复杂性，其研究技术也日新月异，目前得到广泛认可应用的是高通量基因分型技术，但是还需要针对每种技术的局限性进行深入研究。 　　【关键词】 结直肠癌； 单核苷酸多态性 　　中图分类号 R574.6 文献标识码 A 文章编号 1674-6805（2015）13-0158-03 　　doi：10.14033/ki.cfmr.2015.13.079 　　结直肠癌（colorectal cancer，CRC）作为一类消化系统疾病，严重危害人类的健康状况。有一项2008年的研究表明，结直肠癌新发病例达120万以上，其中死亡病例约占49%[1]。与2002年全球统计数字比较，结直肠癌发病例数攀升，在男性中已超越胃癌位列第3位，女性中超越宫颈癌位列第2位。由于采取了有效的结直肠癌的筛?耍?美国、加拿大、澳大利亚等发达国家的发病率呈下降或稳定趋势[2]。 　　随着人类基因组计划（Human Genome Project，HGP）和基因组单倍体图谱计划（International Human Hap Map Project）的完成和实施，以及高通量基因分型技术的快速发展，关于疾病遗传基因方面的研究日益完善[3]。1996年Lander正式指出单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）开启了新的分子标记时代[4]。SNP数量多、分布广，利于快速、大范围筛查。对其进行全面深入的研究将有助于揭示复杂疾病的遗传机制、疾病病因、基因与药物代谢和敏感性的关系、基因与环境的相互作用等，锁定高发人群，做好预防工作，早期诊断和治疗。本文主要目的就是系统总结SNP的研究进展，为以后的工作明确研究方向。 　　1 SNP的研究进展 　　1.1 SNP概述 　　SNP主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性，属于人类可遗传变异中最常见的一种，占90%以上。通常引起SNP的原因有两个：一是单个基因的转换，一个嘧啶被另一个嘧啶，或者一个嘌呤被另一个嘌呤所替代；另一个是颠换，嘌呤和嘧啶之间的变换。转换与颠换之比约为2∶1：且以C→T最为多见。SNP大量存在于人类基因组，可出现在基因序列的不同部位，虽然编码区的变异率很低，但对疾病的研究最有意义[5]。编码区的SNP（coding SNP，cSNP）分为两类，包括同义cSNP（synonymous cSNP）以及非同义cSNP（non-synonymous cSNP），目前对cSNP的研究备受关注。 　　1.2 SNP研究方法 　　SNP的研究方法日益完善，目前最受关注的是大规模全基因组关联分析（Genome-wide Association Study，GWAS）。GWAS指的是对个体中能发现的SNP应用高通量基因芯片技术进行分析，找到与疾病有关的位点，重点研究分析验证，其特点为大样本的人群、全基因组[6]。从2005年起，研究者陆续报道了视网膜黄斑、冠心病、风湿性关节炎、克罗恩病、糖尿病、乳腺癌、结直肠癌、前列腺癌、自闭症等几十种疾病的关联分析结果，均取得重大进步[7-10]。其中，SNP检测分析方法，传统方法有单链构象多态性、限制性酶切片段长度多态性、等位基因特异性杂交等等.这些传统方法虽广泛应用过，但不可避免的存在局限性，过分依赖于凝胶电泳技术，准确率不高，操作繁琐，对象比较局限等[11-12]。要想在SNP的研究上取得更大进展，这些缺点均需要克服。另外，高通量SNP检测技术有基因芯片、多元焦磷酸测序进行SNP的鉴别[13]。Taqman探针技术有同时应用杂交和荧光检测技术，在PCR技术中对同一目的SNP位点设计两端分别标记有报告荧光集团和淬灭荧光集团的两对探针，若探针完整，则报告荧光集团所发出的荧光信息会被淬灭荧光集团吸收，最后应用荧光检测技术检测荧光信息来进行基因分型。该技术虽然操作灵活，但是针对的对象目的SNP位点相对局限，无法发现未知的SNP位点。而且随着操作对象的复杂性增加，相对的准确率却下降[14]。 　　质谱法（Mass spectrometry）。在应用PCR技术扩增后的目标DNA上进行延伸，该处所需的引物在5’端加入了生物素，其目的为纯化延伸的DNA产物。把产物和芯片基质相结合，并通过质谱仪作用，产生有不同飞行时间的单电荷离子，通过复杂分析后确定SNP分型[15]。该技术无需杂交，操作简单，准确度高，速度快，但其难点在于加强分离纯化操作技术。 　　2 结直肠癌SNP研究进展 　　2.1 DNA修复基因多态性与结直肠癌关联