chap3_二庑em数据分析(精品·公开课件).pptVIP

习题 1-PAM矩阵平均改变1%的氨基酸，能否说2-PAM矩阵平均改变2% 用Blast在GenBank中查询序列GAATTCCAATAGA，命中了什么数据库序列 S和t的长为l的比对，把该比对拆成两部分，一个从列1到列k，另一个从列k+1到l。计分系统的什么性质保证对任意的k整个比对的计分是其部分比对计分的和 BLAST BLAST BLAST 二代测序数据分析 2012/9/25 测序数据分析流程 短片段序列 短片段Mapping 基因型估计 关联分析 短序列片段 Fastq格式 文本文件 包含短片段序列（reads）和碱基测序质量 示例 @HWI-EAS209_0006_FC706VJ:5:58:5894:21141#ATCACG/1 TTAATTGGTAAATAAATCTCCTAATAGCTTAGATNTTACCTTNNNNNNNNNNTAGTTTCTTGAGATTTGTTGGGGGAGACATTTTTGTGATTGCCTTGAT +HWI-EAS209_0006_FC706VJ:5:58:5894:21141#ATCACG/1 efcfffffcfeefffcffffffddf`feed]`]_Ba_^__[YBBBBBBBBBBRTT\]][]dddd`ddd^dddadd^BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB 短序列片段 长度：35 - 120bp 碱基