常见的第7章基因水平转移.ppt

第七章 微生物基因水平转移 课时：4 学时 授课方式：讲授＋讨论 开课时间：2014年秋季学期 主要内容 细菌可移动遗传元件 水平基因转移生物进化意义 水平基因转移障碍 水平基因转移方式及机制 水平基因转移环境修复领域意义 第一节：细菌的可移动遗传元件 水平基因转移 (horizontal gene transfer) 差异生物个体之间，或单个细胞内部细胞器之间所进行的遗传物质的交流 水平基因转移不仅发生在细菌之间，而且也发生在细菌与高等动物之间，甚至高等动物之间 水平基因转移打破了亲缘关系的界限，使基因流动的可 能变得更为复杂 微生物水平转移增加了微生物的多样性；提高了微生物 适应新环境能力 意义 第一节：细菌的可移动遗传元件 细菌的可移动遗传元件 分为核心基因库和易变基因库 核心基因库：位于染色体DNA上，大部分编码负责细胞基本功能的蛋白质 易变基因库 DNA具有移动元件的特征 细菌的可移动遗传元件：噬菌体、质粒、转座因子、整合子、基因岛 第一节：细菌的可移动遗传元件 质粒 质粒 细菌中能自我复制的染色体外DNA遗传元件 质粒与染色体DNA 质粒为最常用水平基因转移工具 分为接合型质粒和非接合型质粒 第一节：细菌的可移动遗传元件 噬菌体的基因转移元件 其基因转移对于细菌的生长繁殖及进化过程有重要的作用 噬菌体是感染细菌、真菌、放线菌或螺旋体等细菌病毒总称， 具有病毒特有的一些特性：个体微小；不具完整细胞结构；只含单一核酸 第一节：细菌的可移动遗传元件 转座因子(transport element, TE) DNA分子具有转座因子，帮助DNA分子在位点之间转移 不具有自我复制功能，但是它们具有可复制插入后的宿主DNA 插入寄主DNA后，导致基因失活 插入时在靶DNA位点产生一个短的同向重复顺序 DNA转座子(DNA transponson)，存在于原核生物和真核生物。转座过程从DNA→DNA RNA转座子(RNA transponson)，存在于真核生物。转座过程是以RNA为中间体，从DNA → RNA → cDNA → DNA 类型 第一节：细菌的可移动遗传元件 插入序列 (Insertion sequence, IS) 最简单的转座因子，可独立存在，也可以作为其它转座因子的一部分存在于某些细菌 特点 在IS两端含有长度为10-40bp的反向重复序列，反向重复序列在IS的切割和DNA链转移中起作用 大多数IS含有一个编码转座酶的长编码区。转座酶负责识别切割转座子的两端及靶位点的切口 IS插入时，在靶位点产生短的同向重复序列，分布在IS的两侧 第一节：细菌的可移动遗传元件 复杂转座子(complex transposon) 两端是短(30-40bp)的末端反向复杂序列(IR)或同向重复序列(DR)，中央是转座酶基因和抗药性基因 接合型转座子(conjugative transposon) 通过接合作用转移的转座子，末端没有重复序列，但含有整合酶基因、切离酶基因、接合型转移基因及抗生素基因 接合型转座子综合转座子、质粒、噬菌体的特征，是真正的基因转移因子，能引起抗性基因在许多重要细菌中的扩散 第一节：细菌的可移动遗传元件 Mu噬菌体(mutator phage) Mu噬菌体不同于一般的温和噬菌体 Mu DNA几乎可插入到宿主染色体上任何一个位点上 Mu DNA的两端没有黏性末端，插入到基因中引起该基因的突变 优势 易于识别，不是细菌基因组正常组分 可经诱导产生，易于制备 第一节：细菌的可移动遗传元件 整合子(integron) 运动性DNA分子，可捕获和整合外源性基因，使之转变为功能性基因的表达单位 整合子会转移抗性基因，如图addB基因属于aad基因家族(编码氨基酸甘转移酶，作用于不同的氨基糖苷类抗生素，使其钝化，介导耐药性) aadB主要介导庆大霉素等 基因盒(gene cassette) 能够被整合到整合子上或是整合子上切除的移动元件 基因盒-整合子系统是细菌基因组中的基因克隆和表达单位，能携带位点特异性重组系统组分，形成多种耐药基因的组合、排列 使受体菌获得新的生物学性状，以及微生物新种的形成 第一节：细菌的可移动遗传元件 基因组岛(genomic island，GI) 染色体上可移动遗传元件，通过水平基因转移而获得的外源DNA片段 位于细菌染色体；大小不一(10-200kb)；两端具有重复序列；携带插入序列元件(IS)及整合酶基因(int1)等其他可移动遗传元件 第一节：细菌的可移动遗传元件 基因组岛（例：细菌水平基因转移与进化的工具） 细菌通过变异、重组和水平基因转移进行进化 除了核心基因编码必要的代谢功能，基因组同时拥有大量附属基因。这些基