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- 2018-11-15 发布于江苏
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miR靶位点预常用软件
认为RNA仅是DNA与蛋白质之间的过渡的时代已经终结,microRNA的发现使科研界再次聚焦RNA。
microRNA(miRNA)是一类长22 nt左右的内源非编码小RNA,广泛存在于动物、植物和病毒等物种中。1993年,Lee等人首先在秀丽线虫体内发现了首个miRNA lin-4,进一步研究表明,lin-4 RNA通过与lin-14基因3′ UTR特异性结合降低LIN-14蛋白的表达水平。miRNA基因通常位于基因间或内含子区域,由RNA聚合酶Ⅱ转录产生pri-miRNA,pri-miRNA具有帽子结构和多聚腺苷酸尾巴,pri-miRNA在核酸酶Drosha作用下切割生成70nt左右的pre-miRNA,核酸酶Dicer切割pre-miRNA最终生成22nt左右的miRNA单链分子。成熟的miRNA分子与Argonaute等蛋白形成RNA诱导的沉默复合体(RISC)抑制靶基因表达。
miRNA通过与靶基因mRNA部分互补配对在转录后水平抑制靶基因表达,研究表明,miRNA参与包括细胞增殖、凋亡、分化、代谢、发育和肿瘤转移等各种生物学过程。但miRNAs与其靶基因并非完全匹配,这给确定miRNA靶基因带来难度。科研人员通过分析已知miRNA及其靶基因,发现如下重要特征:靶基因3′ UTR区具有与miRNA 5′端至少7个连续核苷酸的完全配对区域(2-8nt),miRNA的该部分序
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