小蛋白质富集法鉴定酿酒酵母漏检蛋白.PDF

1860 生 物 工 程 学 报 何崔同 等/小蛋白质富集法鉴定酿酒酵母“漏检蛋白” Chinese Journal of Biotechnology /cjbcn Nov. 25, 2018, 34(11): 1860−1869 DOI: 10.13345/j.cjb.180046 ©2018 Chin J Biotech, All rights reserved ·生物技术与方法· “” 1,2 2,3 1,2 1,2 何崔同 ，张瑶 ，姜颖 ，徐平 1 安徽医科大学，安徽 合肥 230032 2 军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所 蛋白质组学国家重点实验室 国家蛋白质科学中心 (北京) 北京蛋白质 组研究中心，北京 102206 3 中山大学 生命科学学院，广东 广州 510275 何崔同, 张瑶, 姜颖, 等. 小蛋白质富集法鉴定酿酒酵母“漏检蛋白”. 生物工程学报, 2018, 34(11): 1860–1869. He CT, Zhang Y, Jiang Y, et al. Identification of missing proteins in Saccharomyces cerevisiae by small protein-based enrichment. Chin J Biotech, 2018, 34(11): 1860–1869. 摘 要: 小蛋白质 (Small proteins ，SPs) 是由小开放阅读框 (Short open reading frames ，sORFs) 编码长度小于 100 个氨基酸的多肽。研究发现小蛋白质参与了基因表达调控、细胞信号转导和代谢等重要生物学过程。然而， 生命体中大多数的已注释小蛋白质尚缺少蛋白水平存在的实验证据，被称为漏检蛋白 (Missing proteins ，MPs) 。 小蛋白质的高效鉴定是其功能研究的前提，也有助于挖掘“漏检蛋白” 。文中采用小蛋白质富集策略鉴定到 72 个 酵母小蛋白质，验证9 个“漏检蛋白” ，发现低分子量、高疏水性、膜结合、弱密码子使用偏性及不稳定性是蛋白 漏检的主要原因，对进一步的技术优化具有指导意义。 : 蛋白质组学，小蛋白质，富集，漏检蛋白 Identification of missing proteins in Saccharomyces cerevisiae by small protein-based enrichment Cuitong He1,2, Yao Zhang2,3, Ying Jiang1,2, and Ping Xu1,2 1 Anhui Medical University , Hefei 230032, Anhui , China 2 Beijing Institute of Radiation Medicine, State Key Laboratory of Proteomics, National Center for Protein Sciences (Beijing), Beijing Proteome Research Center, Beijing 102206, China 3 School of Life Sciences,