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- 2018-12-08 发布于江苏
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小RNA测序地一些可选地生物信息分析内容
小RNA测序的一些可选的生物信息分析内容
一、Small RNA深度测序分析
????????分子RNA(Small RNA)是生命活动的一类重要调控因子,长约10~40nt,广泛存在于从低等的病毒、线虫、植物到高等的动物机体中。主要包括微RNA(miRNA)、小干扰RNA(siRNA)、与piwi相互作用的RNA(piRNA)三类,它们通过包括mRNA降解、翻译抑制、异染色质形成等多种途径,在生物体基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等过程中发挥着重要作用。????????Small RNA结合Illumina HiSeq2500/MiSeq新一代测序平台,一次性可获得数百万条sRNA序列,通过生物信息方法,可以在全基因组水平快速鉴定和预测各种类型的Small RNA,得到其可能调控的基因的功能,为Small RNA功能及其对基因调控机制的研究提供了有力工具。????????目前,提供1×50bp读长,HiSeq2500、MiSeq两种测序平台的Small RNA测序和信息分析服务。
技术优势
????????精确度高:可以检测出sRNA单个碱基的差异;????????灵敏度高:可以检测出组织中几个到几万个拷贝的sRNA;????????价格低廉:一次可产出上百万条序列;????????样品起始量低:使用NEB原装small RNA建库试剂盒及配套试剂,样品起始
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