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小鼠遗传学及分类命名 顾鹏宇 2008-8 遗传学基础知识 实验小鼠起源 实验小鼠的分类及其命名 遗传监测 繁育体系 基因的命名 没有特定的命名体系,因此比较混乱 通过基因功能命名 (通常为酶) Nos2, Sod1 通过基因产物的大小命名 p53, p21 通过表型命名 Apc, Rb, Mom1 同物异名 当基因功能确定后命名常会发生改变 单个基因有多个功能时通常会有多个名字 基因型/表型 基因型(Genotype) 狭义 = 个体特定基因的等位基因组成情况 广义 = 个体所有基因的整套等位基因(整个遗传背景或基因组) 表型(Phenotype) 狭义=因特定基因的等位基因组成而引起的个体特征 广义=因个体的基因组组成而引起的一系列解剖,生理和行为学等特征 小鼠基因组学 人基因组 ~3 billion bp 小鼠基因组~ 3 billion bp 其它模式生物基因组大小 果蝇 ~ 140 million bp (21-fold less) 线虫 ~ 97 million bp (31-fold less) 酵母 ~ 12 million bp (250-fold less) 细菌 (E. coli) ~ 5 million bp (600-fold less) 小鼠基因组学 小鼠是研究人类基因功能最好的模式动物 C57BL/6, BALB/c, C3H 是历史上最常使用的小鼠 C57BL/6, 129, FVB最常使用的基因工程小鼠 可获取基因组序列的小鼠品系 C57BL/6 (NIH Mouse Sequencing Consortium) A/J2, DBA/2, 129X1/SvJ, 129S1/SvImJ (Celera Genomics) 小鼠基因组学 小鼠基因组大概包含30,000 到 50,000 个不同基因 (~2000 个每染色体) 至少 50% 与人类基因同源 (相似的序列和功能) 与人类基因同源的小鼠基因的命名 Nitric oxide synthase 2 Human gene = NOS2 (斜体, 全大写) Mouse gene = Nos2 (斜体, 首字母大写) Protein = NOS2 (正体,全大写) 小鼠功能基因组学 基因型驱动的或”正向”基因组学 引入突变 (遗产工程) 筛选表型改变 具有人为偏好的特点 表型驱动的或”反向”基因组学 随机突变后观测表型改变或随机引入点突变 (by ENU)观测表型改变 找出表型相关基因位点 鉴定未知基因,基因功能 需要大量筛选工作 实验小鼠起源 History of the Laboratory Mouse 1100 BC- color-variant mice (China) 1909- first inbred strain 1929- The Jackson Laboratory 1962- nude mouse 1980- first transgenic mouse 1989- first knockout mouse 1990s- conditional/inducible knockouts, knock-in, mouse genome project 2002- RNA interference knockouts? 封闭群（远交群）Closed Colony or Outbred Stock 以非近亲交配方式进行繁殖生产的一个实验动物种群，在不从其外部引入新个体的条件下，至少连续繁殖4 代以上，封闭群亦称远交群。 Lab code: stock symble 例如：N: NIH 表示由美国国立卫生研究院（N）保持的NIH 封闭群小鼠。 Lac: LACA 表示由英国实验动物中心（Lac）保持的LACA封闭群小鼠。 某些命名较早，又广为人知的封闭群动物，名称与上述规则不一致时，仍可沿用其原来的名称。如：Wistar大鼠封闭群，日本的ddy封闭群小鼠等。 近交系：经至少连续20 代的全同胞兄妹交配培育而成，品系内所有个体都可追溯到起源于第20代或以后代数的一对共同祖先。 经连续20 代以上亲代与子代交配与全同胞兄妹交配有等同效果。 近交系的命名 基于毛色 DBA (Dilute Brown nonAgouti, first inbred mouse) 基于起源 NZW (New Zealand White) 基于表型 NOD (Non-Obese Diabetic) 其它 BALB/c, C57BL, 129 近交系的命名 1．一般均用一个或几个大写英文字母表示，如A、AE、BA、AKR、DBA、NZB、STAR、NMRT、NYLR、NZB