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生工生物宏基因组微生物分类测序项目介绍
生工生物
宏基因组微生物分类测序
项目介绍
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适用范围
本项目流程介绍适用于细菌、真菌、古菌、微
藻类、各功能基因（如硝化/反硝化基因、固氮
基因、氨氧化基因、厌氧氨氧化基因等等）以
及其他客户定制性片段不超过500的DNA多样
性片段；不同的类群在分析内容上会有差异。
1. 名词解释
1
2. 本项目使用软件与数据库 2
2.1 软件 2
2.2 数据库 2
3. 实验流程简介 2
4. 实验流程详述 2
4.1. 材料 2
4.2. 关键试剂 2
4.3. 仪器 3
4.4. 实验步骤 3
5. 分析流程 5
6. 项目分析内容 6
7. 分析流程简介以及方法说明 6
8. 分析结果展示 7
8.1 数据预处理 7
8.1.1 方法说明 7
8.1.2 结果展示 8
8.2 去除嵌合体及靶区域外序列 9
8.2.1 方法说明 9
8.2.2 结果展示 10
8.3 操作分类单元(OTU)分类 10
8.3.1 方法说明 10
8.3.2 结果展示 10
8.4 赋予物种分类单元 13
绍 介 目 项 类 分 物 生 微 组 因 基 宏 8.4.1 方法说明
13
8.4.2 结果展示 13
8.5 Alpha多样性分析 19
8.5.1 方法说明 19
8.5.2 结果展示 20
8.6 Beta多样性分析 24
8.6.1 方法说明 24
8.6.2 结果展示 24
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