显微CT血管系统三维结构的骨架细化算法并行化设计实现.PDFVIP

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2018-12-06 发布于天津
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显微CT血管系统三维结构的骨架细化算法并行化设计实现.PDF

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显微CT血管系统三维结构的骨架细化算法并行化设计实现.PDF

第35卷第11期光学学报 Vol.35,No. 11 2015年11月 ACTAOPTICASINICA November,2015 显微CT血管系统三维结构的骨架细化算法并行化设计实现 1,2 3 1 1 1,2 1,2 谭海王大东薛艳玲王玉丹杨一鸣肖体乔 1 中国科学院上海应用物理研究所, 上海201800 2 中国科学院大学, 北京 100049 3澳大利亚联邦科学与工业研究组织, 悉尼NSW 1670 摘要提取骨架是计算机断层扫描(CT)三维(3D)血管图像定量分析中的关键步骤，通常耗费数小时，直接制约了图像分析的定量研究。分析串行骨架细化算法各步骤中包含的可并行化操作，对其进行并行化设计，提出的算法通过OpenMP多线程技术实现，并采用不同大小的三维CT血管图像进行分析和测试。根据测试结果，改进后的算法获取到的骨架准确可靠，对于 1.95 GB大小的三维血管图像，使用 16个线程进行并行运算时，可将运算时间由176 min缩短到13min，时间消耗上降低了一个数量级。因此，提出的方法可实现大型血管骨架的准确、高效提取，解决了大型三维图像分析问题中运算效率低这一瓶颈问题。关键词医用光学;三维骨架;细化;并行处理;OpenMP;加速比中图分类号 TP751.1 文献标识码 A doi: 10.3788/AOS201535.1117003 Parallelizationof 3DThinningAlgorithmforExtracting SkeletonofMicro-CTVasculature 1,2 3 1 1 TanHai WangDadong XueYanling WangYudan 1,2 1,2 YangYiming XiaoTiqiao 1ShanghaiInstituteofAppliedPhysics,ChineseAcademyofSciences,Shanghai 201800,China 2UniversityofChineseAcademyofSciences,Beijing 100049,China 3CommonwealthScientificandIndustrialResearchOrganization,SydneyNSW 1670,Australia Abstract Theextractionofskeletonisoftenacrucialstepinquantitativeassessmentofthree-dimensional(3D) vasculaturecomputedtomography(CT)image.Theprocessalways