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S-W算法在NGS应用下的测试与分析
摘要:生物序列比对是生物信息学中最常见的问题之一,它承载着正确还原和判断生物序列的重要工作。NGS在吞吐率提高的同时,比对的错误率也有明显上升,如何提高比对命中率成了工程师们不得不面对的一个问题。本文通过实验样品的特异性差异,针对性的对不同样本状况调整碱基匹配的优先级策略,整体上提高了比对的命中率。
关键词:S-W算法、NGS应用、测试、分析
生物信息学中,生物信息需要借助计算机编码来表达遗传信息,基于已有的技术手段,NGS(New Generation Sequencing-新一代基因测序)已经足够成熟,由NGS测
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