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蛋白质相互作用的生物信息学 高友鹤 蛋白质相互作用的生物信息学 实验数据 蛋白质相互作用数据库 高通量实验数据的验证 蛋白质相互作用网络 计算预测蛋白质相互作用 实验数据 蛋白质相互作用的知识来源于实验。 高通量地应用传统实验方法获取大量相互作用信息。 高通量的数据需要验证。 高通量实验方法 Yeast two-hybrid assay Benefits: in vivo. Don’t need pure proteins. Don’t need Ab. Drawbacks: only two proteins are tested at a time (no cooperative binding); it takes place in the nucleus, so many proteins are not in their native compartment; and it predicts possible interactions, but is unrelated to the physiological setting. Mass spectrometry of purified complexes Benefits: several members of a complex can be tagged, giving an interna