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Introduction to Algorithms
6.046J/18.401J/SMA5503
Lecture 15
Prof. Charles E. Leiserson
Dynamic programming
Design technique, like divide-and-conquer.
Example: Longest Common Subsequence (LCS)
• Given two sequences x [1 . . m] and y [1 . . n], find
a longest subsequence common to them both.
“a” not “the”
x : A B C B D A B
BCBA =
LCS(x , y )
y : B D C A B A
functional notation,
but not a function
© 2001 by Charles E. Leiserson© 2001 by Charles E. Leiserson Introduction to Algorithms Day 26 L15.2
Brute-force LCS algorithm
Check every subsequence of x [1 . . m] to see
if it is also a subsequence of y [1 . . n].
Analysis
• Checking = O(n) time per subsequence.
• 2m subsequences of x (each bit-vector of
length m determines a distinct subsequence
of x).
Worst-case running time = O(n2m)
= exponential time.
© 2001 by Charles E. Leiserson© 2001 by Charles E. Leiserson Introduction to Algorithms Day 26 L15.3
Towards a better algorithm
Simplification:
1. Look at the length of a longest-common
subsequence.
2. Extend the algorithm to find the LCS itself.
Notation: Denote the length of a sequence s
by |s |.
Strategy: Consider prefixes of x and y .
• Define c[i,j ] = | LCS(x [1 . . i], y [1 . .j ]) |.
• Then, c[m, n] = | LCS(x , y ) |.
© 2001 by Charles E. Leiserson© 2001 by Charles E. Leiserson Introduction to Algorithms Day 26 L15.4
Recursive formulation
Theorem.
c[i–1, j –1] + 1
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