生物化学课件(杨洋)2核酸结构与功能2.ppt

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三叶草型结构特点 (1)氨基酸臂:由7个碱基对组成,含G较多,3’-CCA-OH 连接氨基酸; (2)双氢尿嘧啶环(DHU环):由8~11个核苷酸组成;含 DHU (二氢脲嘧啶) ; (3)反密码环:由7个核苷酸组成,中间3个相邻的核苷酸 组成反密码子,与mRNA上密码子配对; (4)额外环(可变环):由3~18个核苷酸组成,不同的 tRNA此环大小不等,是tRNA的分类标志; (5)T?C环:由7个核苷酸组成,含胸苷、假尿苷、胞苷 可能与AA特异结合相关 反密码子环 反密码子 载运氨基酸 tRNA三叶草型二级结构特点 四. 核糖体RNA(rRNA)的结构与功能 21种 原核 真核 小亚基 rRNA 蛋白质 rRNA 蛋白质 大亚基 16 S 18 S 33种 5S,23S 5S,5.8S , 28S 49种 34种 大 小 30 S 40 S 大 小 50 S 60 S 核糖体 大 小 70 S 80 S rRNA+ 蛋白质 核糖体 核糖体的组成 核糖体的功能:蛋白质合成的场所 五. 其它小分子RNA (snmRNAs) 核内小RNA (snRNA) 核仁小RNA (snoRNA) 胞质小RNA(scRNA) 催化性小RNA (small catalytic RNA) 小片段干扰RNA (siRNA) 功能:参与hnRNA和rRNA的转运和加工 核酶 (ribozyme) 某些RNA分子具有自我催化能力,可以完成 rRNA的剪接,称核酶。 1982,T.R.Cech,四膜虫rRNA加工 第五节 核酸的理化性质和应用 一、核酸的酸碱性质 核酸通常显酸性,在中性或偏碱性条件下带负电荷 电泳:由负极向正极泳动 沉淀:盐溶液中金属离子中和负电荷 二、核酸的高分子性质 粘度大 核酸发生变性或水解时,粘度变小 不同种类的核酸分子其分子量不同,形状不同 分离:电泳、凝胶过滤、超速离心 三、核酸的紫外吸收 核酸分子中的碱基都有共轭双键,具有紫外吸收性质 吸收峰在260nm,可用于核酸的定量 四、DNA的变性、复性与杂交 在某些理化因素作用下,DNA 分子互补碱基对之间氢键断裂, DNA双螺旋打开,变为单链。 概念 因素 加热、酸、碱、有机溶剂 理化性质改变 高色效应(A260增加) 粘度降低 比旋度下降 变性 (一)核酸变性 变性后其它理化性质变化: 粘度下降 DNA双螺旋是紧密的刚性结构,变性后转化成柔软而松散的无规则单股线性结构,因此粘度明显下降。 比旋度下降 变性后整个DNA分子的对称性及分子构型改变,使DNA溶液的旋光性发生变化。 OD260增高 增色效应(hyperchromic effect):指DNA变性后其紫外吸收 明显增强的效应。 减色效应:DNA复性时,其溶液OD260降低。 在DNA双螺旋结构中碱基藏入内侧,变性时DNA双螺旋解开,于是碱基外露,碱基中电子的相互作用更有利于紫外吸收,故而 产生增色效应。 DNA变性的本质:维持双螺旋稳定性的氢键断裂,碱基间的堆积力遭到破坏,但不涉及到其一级结构(磷酸二酯键)的改变。 DNA的热变性 加热引起的DNA变性 DNA解链或溶解 解链温度(melting temperature, Tm) DNA加热变性时, A260为最大值的一半时的解链温度。 Tm = 69.3+0.41(%G+C) Tm = 4(G+C)+2(A+T) (20bp) A260 解链温度(oC) Tm * * * 第二章 核酸的结构与功能 Structure and Function of Nucleic Acid 核 酸(nucleic acid) 是以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。 二. 核酸的种类、分布和功能 分布于细胞核(98%),线粒体,叶绿体, 质粒。 分布于胞核、胞液(90%)。 (deoxyribonucleic acid, DNA) (ribonucleic acid, RNA) 脱氧核糖核酸 核糖核酸 携带遗传信息,决定细胞和个体的基因型(genotype)。 参与细胞内DNA遗传信息的表达。某些病毒RNA也可作为遗传信息的载体。 第二节 核酸的化学组成 一. 核酸的元素组成 C H O N P 二. 核酸的基本结构单位—核苷酸 RNA:8.5% ~ 9% DNA:9% ~ 10% P含量最稳定 9 ~10% 核酸 核苷酸 磷酸 核苷

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