哈茨木霉Tr1菌株分泌蛋白及Peptaibols.PDFVIP

中国农学通报 2018,34(23):46-52 Chinese Agricultural Science Bulletin 哈茨木霉Tr1菌株分泌蛋白及Peptaibols 合成酶的生物信息学分析 许 勇，戴陈伟，李 静，蔡 标，张 爽，童 琳，叶 红 （安徽省医学科学研究院，合肥230061 ） 摘 要：研究旨在应用生物信息学方法分析生防菌哈茨木霉的分泌蛋白及Peptaibols 合成酶。本研究以 哈茨木霉Tr 1 菌株的11264条假定蛋白质序列为对象，利用SignalP、Protparam 和Swissmodel 等生物信息 学工具预测出分泌蛋白，分析其信号肽特征，从中筛选可能与其生防机制有直接联系的分泌蛋白和 Peptaibols 合成酶，并对这些蛋白质的性质和结构功能进行分析。结果表明：哈茨木霉Tr 1 菌株含有403 个分泌蛋白，其中假定蛋白质PNP53160 和PNP56908 可能起到纤维素酶和几丁质酶的作用。分泌蛋白 的信号肽的中间区域富含亮氨酸和丙氨酸，C 端属于