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核酸的理化性质 The Physical and Chemical Characters of Nucleic Acid 第四节 核酸的酸碱及溶解度性质 核酸为多元酸,具有较强的酸性。 核酸的高分子性质 粘度:DNARNA dsDNA ssDNA 沉降行为:不同构象的核酸分子的沉降的速率有很大差异,这是超速离心法提取和纯化核酸的理论基础。 核酸在波长 260nm 处有强烈的吸收,是由碱基的共轭双键所决定的。这一特性常用作核酸的定性和定量分析。 一、核酸分子具有强烈的紫外吸收 碱基的紫外吸收光谱 DNA或RNA的定量 A260 = 1.0 相当于 50μg/ml 双链DNA(dsDNA) 40μg/ml 单链DNA (ssDNA or RNA) 20μg/ml 寡核苷酸 确定样品中核酸的纯度 纯 DNA: A260/A280 = 1.8 纯 RNA: A260/A280 = 2.0 紫外吸收的应用 二、DNA变性是双链解离为单链的过程 在某些理化因素作用下,DNA双链解开成两条单链的过程。 定义 DNA变性的本质是双链间氢键的断裂。 协同性的DNA解链 高温或极端的pH DNA的变性 部分变性DNA的电镜图像 增色效应(hyperchromic effect):DNA变性时其溶液OD260增高的现象。 DNA解链时的紫外吸收变化 DNA的解链曲线 连续加热DNA的过程中以温度相对于A260值作图,所得的曲线称为解链曲线。 解链过程中,紫外吸光度的变化达到最大变化值的一半时所对应的温度。 解链温度(melting temperature,Tm) G+C 含量越高,解链温度就越高。 解链曲线的变化 三、变性的核酸可以复性或形成杂交双链 当变性条件缓慢地除去后,两条解离的互补链可重新配对,恢复原来的双螺旋结构,这一现象称为DNA复性(renaturation) 。 减色效应:DNA复性时,其溶液OD260降低。 热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,这一过程称为退火(annealing) 。 不同种类的DNA单链分子或RNA分子放在同一溶液中,只要两种单链分子之间存在着一定程度的碱基配对关系,在适宜的条件可以在不同的分子间形成杂化双链(heteroduplex)。 这种杂化双链可以在不同的DNA与DNA之间形成,也可以在DNA和RNA分子间或者RNA与RNA分子间形成。这种现象称为核酸分子杂交。 核酸分子杂交(hybridization) 核酸分子杂交 研究DNA分子中某一种基因的位置。 监定两种核酸分子间的序列相似性。 检测某些专一序列在待检样品中存在与否。 核酸分子杂交的应用 第五节 核酸酶 Nuclease 依据底物不同分类 DNA酶(deoxyribonuclease, DNase): 专一降解DNA。 RNA酶 (ribonuclease, RNase): 专一降解RNA。 依据切割部位不同 核酸内切酶:分为限制性核酸内切酶和非特异性限制性核酸内切酶。 核酸外切酶:5′→3′或3′→5′核酸外切酶。 核酸酶是指所有可以水解核酸的酶。 5’ 5’ 3’ 3’ 外切位点 外切位点 内切位点 内切位点 参与DNA的合成、修复以及RNA的剪接。 清除多余的、结构和功能异常的核酸,以及侵入细胞的外源性核酸。 降解食物中的核酸。 体外重组DNA技术中的重要工具酶 。 核酸酶的功能 谢谢! The forces stabilizing the DNA double helix can be overcome by heating the DNA in solution or by treating it with very high or very low pH (low pH will also damage the DNA, whereas high pH will simply separate the polynucleotide chains). When the strands of DNA separate, the DNA is said to be denatured (when high temperature is used to denature DNA, the DNA is said to be melted). Because some of the forces stabilizing the DNA double helix are contributed by base pairing interactions, and because A-T base pairs have only two hydrogen bonds in contrast to
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