结构生没物学7.pptVIP

蛋白质的结构层次 蛋白质的一级结构 蛋白质的二级结构 蛋白质的超二级结构与折叠 结构域和蛋白质的三级结构 蛋白质的四级结构 蛋白质的二级结构 二级结构的定义 二级结构的类型 二级结构与Ramachandran图 二级结构的可变性 二级结构的定义 二级结构是多肽链骨架（主链）的局部空间结构，不涉及侧链的构象及整个肽链的空间排列。 二级结构是局部肽段的构象 二级结构是由氢键维系的 二级结构是完整肽链构象的结构单元，也称构象单元 二级结构的类型 规则的二级结构 a螺旋 b折叠 部分规则的二级结构 b转角 W 环形 无规卷曲 a螺旋 基本结构参数 螺旋偶极矩 两亲性螺旋 倾向于形成a螺旋的氨基酸 310螺旋和p螺旋 a螺旋的结构参数和特征 构象角：(φ,ψ)＝ (-57?,-47?) 3.6残基/圈，5.4?/圈 第n个残基的C=O与第n+4个残基的N-H形成氢键，O?Ｎ之间的距离为2.86?； N端的前4个残基的NH和C端的最后4个残基的C=O不能形成氢键，因此在肽链的N端和C端不易形成a螺旋 一个氢键闭合环之间包含13个原子，故a螺旋又称3.613螺旋 主链形成中心圆柱，R基团向外伸出；螺旋中心没有空腔，具有原子密堆积结构 长度可变：4~40个残基都有发现，平均长度约10个残基，相当于15?长 螺旋偶极矩 肽单位中C=O和N-H都具有极性，使每个肽单位产生一个偶极矩 a螺旋中所有