已知基因序字列的获取策略.pptVIP

Primer Premier 5.0 引物设计 限制性内切酶位点分析 DNA基元(motif)查找 同源性分析 Genetool V 2.0 Oligo6.69 四、测序图比对、拼接与虚拟克隆(in silico cloning) 常用本地软件：Clone manager、Vector NTI、DNAstar和ds-Gene等 在线工具：BLAST等 常用序列拼接软件 DNAstar 的SeqMan模块 VectorNTI程序的Contig Express模块 Sequencher 开始→所有程序→DNAstar →SeqMan 新的拼接任务 添加序列 打开保存序列的文件夹 选择序列 导入 整理一下末端 用鼠标拖动手动更改末端 用鼠标点击更改序列方向和形式 选择载体 自动查找 拼接 看看结果 点开测序图 6种阅读框 选择的序列的位置 NCBI查询所选择的序列 保存结果 打印成PDF文件也是一个不错的选择 运行VNTI 程序Contig Express 程序窗口，可以设定参数，一般用默认值即可。 导入测序结果（文件扩展名ab1改成abi）相关软件 EditView for Macs ；Chroma for Windows] 也可以用鼠标右键 导入后可以双击查看和编辑各个测序结果 选择序列，根据实际情况调整序列末端 选择序列拼接 双击查看结果 输出结果到剪贴板，注意最上面的像机