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第二章dn系a的结构
第一节 遗传物质的本质 第二节 核酸的化学组成 第三节 DNA的二级结构 第四节 DNA的物理化学性质 第五节 超螺旋和拓扑异构 第一节 遗传物质的本质 第二节 核酸的化学组成 第二节 DNA的二级结构 第四节 DNA的物理、化学性质 基因组的复杂性=单一序列的长度+重复序列的长度 第五节 超螺旋和拓扑异构 1、反向重复序列与二级结构 反向重复序列(inverted repeatitive sequence or inverted repeats IR) 又称回文序列(廻文):指两段同样的核苷酸序列同时存 在于一个分子中,有时也有不完全相同的情况 RNA和DNA中都可能存在 此外还可有directed repeatitive sequence ---正向重复序列 四、一些DNA序列的不寻常结构 C 反向重复序列间间隔较短或无间隔 反向重复序列间间隔较长 * 较短的回文序列可能是作为一种信号 如:限制性内切酶的识别位点 一些调控蛋白的识别位点 例如限制性内切酶 EcoRⅠ的识别位点 5‘--GAATTC--3’ 3‘--CTTAAG--5’ (1) 形成条件 一股为嘌呤,另一股为嘧啶的核苷酸双链能够形成三链 如: polyA/polyU polydA/polydT polyd (AG)/polyd(CT) 2、三螺旋DNA (Trible Helix DNA, T.S DNA) 可能与基因调控区域的功能和染色体重组有关 PolyT/A TTTTTTTTTTT AAAAAAAAAA PolyT/A TTTTTTTTTTT AAAAAAAAAA TTTTTTTTTTT AAAAAAAAAA TTTTTTTTTTT AAAAAAAAAA D.S. DNA + D.S.DNA T.S. DNA + S.S. DNA (2) 组成形式 第三条链位于B-DNA的 Major groove中 3、 四股螺旋DNA ( tetraplex DNA, Tetrable Helix DNA ) 均有形成 四股螺旋DNA 的可能 5’---TTAGGGTTAGGGTTAGGG-3’ 3’---AATCCCAATCCC-5’ Poly (G) 染色体端粒高度重复的 DNA序列 形成条件--串联重复的鸟苷酸 ? 已有实验结果表明--真核细胞端粒中存在四链结构 可能的功能 A、 稳定真核生物染色体结构 B、 保证DNA末端准确复制 C、 与DNA分子的组装有关 D、 与染色体的 meiosis mitosis 有关 Hoogsteen Bonding 5’-----TTAGGGTTAGGGTTAGGGT 3’-----AATCCCAATCCC GGG T A DNA双股链的互补 是其结构和功能上的一个基本特征 也是DNA研究中一些实验技术的基础 一、DNA分子的变性 变性(denaturation 或融解 melting):DNA双螺旋区的 氢键断裂,使双螺旋的两条链完全分开变成单链,这 一双链分离的过程叫做变性 1、条件:加热, 极端pH,有机溶剂( 尿素、 酰胺 ),低盐浓度等 2、变性过程的表现 ¤ 是一个爆发式的协同过程,变性作用发生在一个很 窄的温度范围 ¤ 导致一些理化性质发生剧烈变化 表现为: ※ 熔液黏度降低 ※ 沉降速度加大 ※ 浮力密
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