基于线粒体Cytb基因的皖南山区温州光唇鱼种群遗传结构.PDFVIP

中国农学通报 2017,33(32): 121-126 Chinese Agricultural Science Bulletin 基于线粒体Cytb基因的皖南山区 温州光唇鱼种群遗传结构 胡玉婷，江 河，段国庆，凌 俊 （安徽省农业科学院水产研究所，合肥230031 ） 摘 要：为探讨皖南山区温州光唇鱼的种群遗传结构，采用线粒体细胞色素b 基因(Cyt b)对该区5 个野生 种群（祁门、黟县、休宁、旌德和宁国）进行群体遗传变异分析。131 个样本的Cyt b 基因(1141 bp) 中共检 出38 个变异位点（变异率3.33% ）、14 种单倍型。序列碱基的平均含量分别为A(28.2%)、C(29.7%)、T (27.0%)、G(15.1%) ，A+T 含量(55.2%) 明显大于G+C 含量(44.8%)。5 个地理种群的单倍型多样性 (0.0000~0.6799) 和核苷酸多样性(0.0000~0.00759) 普遍较低。群体分化系数(FST: 0.2916- 0.9782) 和 AMOVA 分析中高达52.74%的遗传变异来自地理种群间，说明温州光唇鱼地理种群间已产生显著遗传 分化；但不同水系的种群间没有显著遗传差异。群体间系统进化树显示：5 个群体聚为两大进化枝，祁 门和旌德种群为一枝，其余种群为另一枝。温州光唇鱼的这种种群遗传结构与地理隔离及其生态习性 相关。 关键词：温州光唇鱼；细胞色素b ；群体遗传结构；皖南山区 中图分类号：S917.4 文献标志码：A 论文编号：cas PopulationGeneticStructureofAcrossocheiluswenchowensis inMountainousAreaof SouthernAnhuiProvinceBasedonMitochondrialCytbgene HuYuting,JiangHe,DuanGuoqing,LingJun (FisheriesResearchInstitute,AnhuiAcademyofAgriculturalSciences,Hefei230031) Abstract: Inordertostudythepopulationgeneticstructureof Acrossocheiluswenchowensis inmountainous areaofsouthernAnhuiProvince,mitochondrialcytochromeb(Cytb)genefrom 5populations(Qimen,Yixian, Xiuning,JingdeandNingguo)with 131 individualsof A.wenchowensis wereamplifiedandsequencedbi- directionally.Finally 14haplotypeswereidentifiedand 38mutationsitesweredetected.Theaveragecontents ofT,C,AandGwere27.0%,29.7%,28.2%and15.1%respectively,A+Tcontent(55.2%)washigherthanG+ Ccontent(44.8%).Thehaplotypediversity(0.0000-0.6799)andnucleotidediversity(0.0000-0.00759)ofthe 5populationswerealllow.Thegeneticdifferentiationindex(F )ofpopulationsrangedfrom0.2916to0.9782. ST Analysisofmolecularvariance