整合分析多组学数据筛选疾病靶点的精准医学策略.pdfVIP

篷 Hereditas(Beijing)2015年7月，37(7)：655—663 WWW．chinagene．cn 综 述 整合分析多组学数据筛选疾病靶点的精准医学策略 谢兵兵 1,2，杨亚东 ，丁楠 1,2 方向东 1．中国科学院北京基因组研究所，中国科学院基因组科学与信息重点实验室，北京 100101； 2．中国科学院大学，北京 100049 摘要：随着高通量测序技术的不断发展与完善，对于不同层次和类型的生物组学数据的获取及分析方法也日趋 成熟与完善。基于单组学数据的疾病研究已经发现了诸多新的疾病相关因子，而整合多组学数据研究疾病靶点 的工作方兴未艾。生命体是一个复杂的调控系统，疾病的发生与发展涉及基因变异、表观遗传改变、基因表达 异常以及信号通路紊乱等诸多层次的复杂调控机制，利用单一组学数据分析致病因子的局限性愈发显著。通过 对多种层次和来源的高通量组学数据的整合分析，系统地研究临床发病机理、确定最佳疾病靶点已经成为精准 医学研究的重要发展方向，将为疾病研究提供新的思路 ，并对疾病的早期诊断、个体化治疗和指导用药等提供 新的理论依据。本文详细介绍了基因组、转录组和表观组等系统组学研究在疾病靶点筛选方面出现的新技术手 段和研究进展，并对它们之间的整合分析新策略和优势进行了讨论。 关键词：基因组；转录组；表观遗传组；整合分析；疾病靶点 Identificationofdiseasetargetsforprecisionmedicinebyintegrative analysisofmulti·omicsdata BingbingXie ，YadongYang ，NanDing ，XiangdongFang J．CASKeyLaboratoryofGenomeSciencesandInformation，BejiingInstituteofGenomics，ChineseAcademyofSciences，Beijing 100101，China； 2．Universi ofChineseAcademyofSciences，Bejiing100049,China Abstract： Withthedevelopmentandimprovementofhigh-throughputsequencingtechnologies，theacquisition andprocessingapproachesofvariousbiologicalomicsdataon differentlevelsarebecomingmoremature．Despite severalnew disease．associated factorshavebeen discoveredbasedon singleomicsdataanalysis。identificationof diseasetargetsbyintegrativeanalysisofmulti—omicsdataisstillgrowing．Sincelifeisacomplexregulatorysystem inwhichtheregulation ofgenemutations，epigeneticalterations，abnormalgeneexpressionaswellasanomalous variationsinsignalpathwayarerelatedwiththeoccurrenceanddevelopmentofdiseases，itisobviousthatfinding therapeuticfactorsusingsingleomicsdataanalysishasitslimitation．Systematicalstudiesofclinicalandpathological mechanismsand identificationofoptimaltherapeutictargetsthrough integrativeanalysisofmulti—omicsdatafrom differentlevelsandresourceshavebecomeallimportantresearchdirectionofprecisionmedicine，whichwouldpro- 收稿 日期：2015-02-02；修 回日期：2015-03--31 基金项 目：中国科学院干细胞与再生医学研究战略性科技先导专项子课题(编号 ：XDA