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l10一-rnai-07

RNAi RNAi 的发现 1995年,康乃尔大学,Su Guo博士 秀丽新小杆线虫(C. elegans)的par-1基因 反义RNA 阻断基因的表达;正义RNA增强基因的表达 但是:二者都同样地切断了par-1 基因的表达途径 1998年,华盛顿卡耐基研究院的Andrew Fire 马萨诸塞大学医学院的Craig Mello 体外转录所得RNA中污染了微量双链RNA而引起 单链RNA基因抑制效应十分微弱;双链RNA能够高效特异性阻断相应基因的表达。 该小组将这一现象称为RNA干扰(RNA interference ,简称RNAi) RNAi现象被广泛地发现于真菌、拟南芥、水螅、涡虫、锥虫、斑马鱼等大多数真核生物中 RNAi(RNA interference,RNA干扰) *一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型。 *这种现象发生在转录后水平,又称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing,PTGS)。 *近年来,RNA干扰的研究成为热点,预测未来10年间最有可能出重大成果的领域之一,并被《Science》评选为2002年度最重要科技突破的首位。RNAi是细胞本身固有的对抗外源基因及其侵害的一种自我保护现象,是双链RNA(double stranded RNA,dsRNA)分子在mRNA水平关闭相应序列及基因的表达使其沉默的过程。 RNAi的特点 高效性 Elbashir等在研究中发现分别为25 nmol/L与100 nmol/L的dsRNA产生的结果是一样的,只有当浓度降低到0.05 nmol/L时,沉默的效果才消失。Holen等也证实1~100 nmol/L的双链RNA浓度对基因沉默的效果是一致的。 特异性 Elbashir等和Brummel kamp等发现在21~23个碱基对中有1~2个碱基错配会大大降低对靶mRNA的降解效果。 RNAi的特点 需要ATP Zamore等认为RNAi过程中至少有2个步骤需要能量的供给:一是dsRNA被Dicer所酶切产生siRNA;二是在siRNA与RISC结合解链后形成有活性的RISC。 位置效应 Holen等根据人TF(tissue factor)不同的位置各合成了4组siRNA,hTF167i和hTF372i能够抑制85%~90%的基因活性,hTF562i只能抑制部分基因活性,而hTF478i则几乎没有抑制基因的活性。结果还表明siRNA对mRNA的结合部位有碱基偏好性,GC含量较低的mRNA被沉默效果较好。 RNAi的特点 竞争效应 Holen等将10 nmol/L和30 nmol/L的hTF167i相比,两者的沉默基因效果无差异,但将20 nmol/L基因抑制效果很差的PSK314i和10 nmol/L的hTF167i相混和后,hTF167i产生的抑制效果明显降低。 可传播性 在线虫中,双链RNA可以从起始位置传播到远的地方,甚至于全身。Feinberg 和Hunter在线虫细胞膜上发现一种跨膜蛋白SID1,它可以将双链RNA转运出细胞,因此系统性的RNAi包括了SID1介导的双链 RNA在细胞间的运输。 RNAi技术的应用 在功能基因组研究中,需要对特定基因进行功能丧失或降低突变,以确定其功能。 RNAi具有高度的序列专一性,可以特异地使特定基因沉默,获得功能丧失或降低突变,因此RNAi可以用于功能基因组的研究。 M. F. Mett等证明含有启动子区的dsRNA同样可以被切割成21-23核苷酸长的片段,从而使启动子失去功能,使其下游基因沉默。 由于多基因家族的各成员之间高度同源,因而使用编码区 RNAi技术很难将各个成员区分开来研究,而多基因家族内的启动子序列通常比编码区变化大,采用启动子区RNAi技术有望将多基因家族的各个成员区分开来研究。这样综合编码区RNAi技术和启动子区RNAi技术的信息即可更全面地了解多基因家族各成员的功能。 二、RNAi技术在基因治疗上的应用 RNAi具有高效率和高特异性的特点,它是基因沉默疗法的理想工具。 小鼠肝细胞的丙型肝炎病毒、HIV-1病毒、脊髓灰质炎病毒 关闭突变的遗传基因 三、新药研发 四、细胞信号传导通路分析 五、植物的种质改良 RNAi技术路线 一、siRNA的设计 化学合成法(chemical synthesis) 体外转录法(in vitro transcription) 长链dsRNA的RNase

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