第3章相核酸化学.ppt

2、DNA的碱基组成特点——Chargaff定律 （1）所有DNA中腺嘌呤与胸腺嘧啶的摩尔含量相等，（即A=T）;鸟嘌呤与胞嘌呤的摩尔含量相等，（即G=C）。碱基当量定律：嘌呤碱总量=嘧啶碱总量。（即A+G=T+C） （2）不同生物DNA的碱基组成有很大差异，可用不对称比率：A+T/G+C表示。亲缘相近的生物，其DNA的碱基组成相近，即不对称比率相近。 （3）同一种生物所有体细胞DNA的碱基组成相同，可作为该物种的特征。 （1）DNA是一反向平行的互补双链结构。在双链结构中糖-磷酸骨架居外侧，而碱基位于内侧，两条链之间的碱基以氢键相结合。碱基互补配对，A=T,G≡C,一条链的走向为5’—3’，另一条为3’—5’。 3、双螺旋结构模型要点 腺嘌呤 胸腺嘧啶 鸟嘌呤 胞嘧啶 其他组合易相互排斥 例如 G:T ＊因此，DNA 的双股系藉著 A:T 和 G : C的配对关系互 相结合 。 A-T配对 G-C配对 （2）DNA双螺旋为右手螺旋。螺旋直径为2nm，螺旋每旋转一周为10对碱基，螺距为3.4nm，每个碱基平面之间的距离为0.34nm,并形成大沟和小沟。 2.0 nm 小沟 大沟 计算机模拟DNA双螺旋结构（蓝色） 大沟中结合着肽（红色） 双螺旋中的大沟对于DNA和蛋白质结合时的相互识别很重要 ，在沟内可以辨认碱基的顺序。 4.双螺旋结构的稳定因素 DNA双螺旋在生理状态下十分稳定，结构不发生变化。 稳定DNA双螺旋结构的主要作用力 1、碱基堆积力（主要因素） 是双螺旋中垂直方向的作用力 2、氢键 为双螺旋中水平方向的作用力 3、离子键 磷酸基团上的负电荷与介质中的阳离子或阳离子化合物之间所形成的盐键 。 5、DNA双螺旋的类型 (1)B-DNA螺旋： DNA在92%相对湿度的钠盐中的构型。标准的?右手双螺旋，细胞正常状态下DNA存在的构型。 (2)A-DNA螺旋：DNA在75%相对湿度的钠盐中的构型。 (3)Z-DNA螺旋：左手的DNA螺旋，这种螺旋可能在基因表达的调控中起作用。 (4)H-DNA螺旋：三螺旋结构，又称三链DNA(tsDNA) B-DNA Z-DNA 三、DNA的三级结构 定义：是指双螺旋进一步扭曲形成的更高层次的空间结构，也就是比双螺旋更为复杂的构象。 线状DNA形成的纽结、超螺旋和多重螺旋 环状DNA形成的结、超螺旋和连环 类型 DNA的三级结构主要是指双螺旋进一步扭曲形成的超螺旋。 超螺旋即DNA双螺旋的螺旋。 1.真核细胞染色体的DNA念珠状（线形）三级结构 超螺旋 2.原核生物以及真核生物细胞器环状DNA的超螺旋三级结构 细菌等原核生物 质粒 染色体 松弛环形 正超螺旋 解链环形 松弛环形 负超螺旋 固定 负超螺旋 （右手拓扑结构） 自然界通常为负超螺旋。 环状DNA 右旋 RNA的一级结构是由数量极其庞大的四种核糖核酸（AMP、GMP、CMP、UMP）按一定顺序，通过3′,5′—磷酸二酯键连成的线形分子，其表示方法与DNA相同。 RNA的二级结构是短的，不完全螺旋的多核苷酸链。（天然RNA并不像DNA一样都是双螺旋结构，而是单链线形分子。只有局部区域为双螺旋结构。双螺旋区约占RNA分子的50%） RNA的三级结构是在茎环结构基础上进一步扭曲折叠而成的复杂结构。 四、 RNA的结构 这种由单链自身折叠形成的结构称为茎环结构。茎环结构是各种RNA的共同的二级结构特征。 （一）tRNA的结构 tRNA的一级结构 1.由74~93个（多为76个）核苷酸组成单链，沉降系数为4S ； (沉降系数又称为沉降常数，指离心力场中沉降分子下沉的速度，1S=1x10-13秒，S常用来表示核酸分子，蛋白质分子和糖体等的大小） 2.具有不变的（恒定的）核苷酸:U8 、G18 、 G19 3.含较多的修饰核苷酸（稀有碱基）； 4.5ˊ端多为PG ； 3ˊ端多为CCAOH （用来接受活化的氨基酸，又称为接受末端） 2.tRNA的二级结构——三叶草结构 具有四臂四环 3ˊ端为CCAOH 序列 ， 5ˊ端为PG 3. tRNA的三级结构——倒L形结构 tRNA的三叶草型二级结构 1 2 4 叶子 反密码子环 反密码子 载运氨基酸 臂 稀有碱基 RNA中的碱基配对原则 A-U G-C 3 额外环 二氢尿嘧啶环 次黄嘌呤 不同的tRNA具有不同的额外环，所以额外环是tRNA分类的重要指标 假尿嘧啶核苷——胸 腺嘧啶核糖核苷环 tRNA的“倒L”型三级结构 （二）mRNA的结构 ?信使RNA（messenger RNA，mRNA