基于ITS条形码技术分析北京云蒙山杜鹃花属遗传多样性.PDF

中国农学通报 2014,30(25):43-48 Chinese Agricultural Science Bulletin 基于ITS条形码技术分析北京云蒙山杜鹃花属遗传多样性 陈建梅，王钊宇，张立娜，徐 曼，袁 园，张克中，王 杰，崔金腾 （北京农学院园林学院，北京102206） 摘 要：为从分子生物学角度综合评价国内外杜鹃花属物种系统发育关系，采用北京云蒙山地区4 个迎 红杜鹃亚属的迎红杜鹃和1 个杜鹃亚属的照白杜鹃为供试材料进行ITS 序列测定，并与从Genbank 数据 库中得到杜鹃花属17种不同种源的ITS 序列，对22 种杜鹃花亚属供试材料ITS 序列在选用K2 模型，采 用邻接法(neighbor-joining method)和最大似然法(maximum likelihood method)构建系统进化树，分析杜 鹃花亚属中各种源的系统位置，将供试杜鹃花亚属分为2 大类5 小类。22 种供试材料均按照所属亚属 被分到了不同分支，分类结果与传统的形态学分类结果较为一致。通过ITS 序列比对发现，杜鹃花属的 22 份供试材料序列的一致性为95.29% ，说明杜鹃花属ITS 序列具有较高的保守性。同时，杜鹃花属的 22 份供试材料ITS 序列均有不同程度的变异，共有80 个有效变异位点，这些变异位点可以作为杜鹃花 属种源的DNA 指纹特异识别位点。为探讨北京云蒙山杜鹃花属种源的分类地位提供分子证据，对系统 分析云蒙山杜鹃花属野生杜鹃群落的遗传多样性以及特异种质的保护、利用和开发具有重要意义。 关键词：杜鹃花属；条形码技术；ITS 基因序列；系统进化树 中图分类号：S718.54+2 文献标志码：A 论文编号：2014-0530 ExploredGeneticDiversityofBeijingYunmengMountainRhododendron BasedonITSBarcodeTechnology ChenJianmei,WangZhaoyu,ZhangLina,XuMan,YuanYuan,ZhangKezhong,WangJie,CuiJinteng (CollegeofLandscape,BeijingUniversityofAgricultural,Beijing102206) Abstract: Forcomprehensiveevaluationofdomesticandforeign Rhododendron phylogeneticrelationships fromtheperspectiveofmolecularbiology,wesequencedITSof 4R.mucronulatum ofRhodorastrum and 1R. micranthum of Rhododendron which planted in Yunmeng Mountain of Beijing, and got 17 ITS different sequencesof Rhododendron byGenebank.UsingK2 model,weconstructedaphylogenetictreeof 22 ITS sequencesof Rhododendron byneighbor-joiningmethodandmaximumlikelihoodmethod.Weclassified Rhododendron into 2 categoriesand 5 smallclassesbyanalyzingsystemlocationsofeveryprovenanceof Rhododendron. 22 plantmaterialswereclassifiedintodifferentbranchesandtheclassificationresultwasin linewithtraditionalmorphologicalclassificationresult.Wefoundthattheconsistencyofthe 22plan