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第止三章多聚核苷酸与核酸
四、核酸的化学修饰 核酸化学修饰(chemical modification)可发生在碱基、戊糖,甚至磷酸基。构成tRNA的稀有碱基就是化学修饰的结果。最常见的碱基化学修饰是甲基化(methylation)。 DNA的磷酸骨架中还能够发生磷硫酰化修饰,从而解释了为什么硫元素结合到DNA骨架上会使之降解的奥秘。 第 五 节核酸(水解)酶 Nucleases 核酸酶(nuclease)是所有水解核酸的酶的统称。 核酸酶种类多,功能多样。 在细胞内,核酸酶的主要生理功能是参与DNA的损伤修复、转录后加工、核酸降解等核酸代谢过程,也是相关的分子生物学操作中常用工具酶。 (一)按底物专一性分类 DNA酶 (deoxyribonuclease, DNase): 专一降解DNA RNA酶 (ribonuclease, RNase): 专一降解RNA 一、核酸酶有多种 (二)按对底物作用方式不同分类 核酸内切酶:分为限制性核酸内切酶和非特异性限制性核酸内切酶 核酸外切酶:5?→3?或3?→5?核酸外切酶 (三)按对底物二级结构的专一性分类 双链酶:作用于双链核酸 单链酶:作用于单链核酸 二、核糖核酸酶是一类RNA内切酶 (一)胰核糖核酸酶识别嘧啶核苷酸 (二)核糖核酸酶T1识别鸟嘌呤核苷酸 (三)核糖核酸酶T2识别腺嘌呤核苷酸 3种核酸酶作用位点 三、不同脱氧核糖核酸酶有不同的作用方式和产物 (一)胰脱氧核糖核酸酶Ⅰ可切割单链/双链DNA (二)脾脱氧核糖核酸酶Ⅱ产物是3?-磷酸末端的寡聚核苷酸 (三)3?外切酶活性是BAL 31核酸酶的主要功能 (四)限制性内切核酸酶具有位点特异性 四、N-糖苷酶可移去碱基 N-糖苷酶(glycosidase)有多种,各种非特异或碱基特异的糖苷酶可以水解核苷酸的N-糖苷键,去除核苷酸的碱基。 * * * 氨基酸臂 额外环 (二)tRNA有“三叶草”样二级结构和倒“L”形三级结构 TψC环 氨基酸臂 DHU环 反密码环 TψC环 氨基酸臂 DHU环 反密码环 反密码子 tRNA三级结构及氢键的位置 氨基酸臂 额外环 有些氨基酸只有一种tRNA作为载体,而另外的一些氨基酸则需要几种tRNA作为载体。 (三)tRNA有识别mRNA密码的反密码子 * tRNA的功能 活化、搬运氨基酸到核糖体,参与蛋白质的翻译。 * rRNA的结构 三、核糖体RNA与核糖体蛋白组成核糖体 * rRNA的种类(根据沉降系数) 真核生物 5S rRNA 28S rRNA 5.8S rRNA 18S rRNA 原核生物 5S rRNA 23S rRNA 16S rRNA (一)原核、真核rRNA分子质量不同 核糖体的组成 原核生物(以大肠杆菌为例) 真核生物(以小鼠肝为例) 小亚基 30S 40S rRNA 16S 1542个核苷酸 18S 1874个核苷酸 蛋白质 21种 占总重量的40% 33种 占总重量的50% 大亚基 50S 60S rRNA 23S 5S 2940个核苷酸 120个核苷酸 28S 5.85S 5S 4718个核苷酸 160个核苷酸 120个核苷酸 蛋白质 31种 占总重量的30% 49种 占总重量的35% rRNA与核糖体蛋白质共同构成核糖体,是蛋白质生物合成的场所:为肽链合成所需要的mRNA、tRNA、多种蛋白因子提供了相互结合的位点和相互作用的空间环境。 (三)rRNA参与组成的核糖体是蛋白质翻译的场所 四、非信使小RNA具有多样性 除了上述三种RNA外,细胞内存在的许多其他种类的小分子RNA,统称为非信使小RNA(small non-messenger RNAs, snmRNAs)。 snmRNAs 非编码RNA(non-coding RNA)专指那些具有调节作用的小RNA,如siRNA、miRNA等。 snmRNAs的种类 核内小RNA(small nuclear RNA,snRNA) 核仁小RNA(small nucleolar RNA,snoRNA) 胞质小RNA(small cytoplasmic RNA,scRNA) 催化性小RNA(small catalytic RNA) 小干扰RNA(small interfering RNA, siRNA) 微RNA(microRNA,miRNA)等 在hnRNA和rRNA的转录后加工、转运中发挥作用,有的参与基因表达调控等;是现代生物学研究的新领域。 真核细胞内重要的snmRNAs 种类 英文名称 生物学功能 核内小RNA small nuclear RNA (snRNA) 参与hnRNA剪接,包括U1、U2、U4、U5、U6 核仁小RNA small nucleola
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