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京海黄鸡igf-ir igfbp-3基因多态条性及其与生产性能的相关性研究
京海黄鸡IGF.IR、IGFBP.3基因多态性及其与生产性
京海黄鸡IGF.IR、IGFBP.3基因多态性及其与生产性 能的相关性研究
研究生:金崇富 导师:王金玉教授 专业:动物遗传育种与繁殖
(扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州225009)
中文摘要
本研究以IGF.IR、IGFBP.3基因作为影响京海黄鸡生产性能的候选基因,采 用DNA测序、PCR.SSCP和PCR-RFLP技术分析了2个基因单核苷酸多态性,并 与京海黄鸡的生产性能进行相关分析。主要研究结果如下: 1.在京海黄鸡IGF—IR基因外显子区共发现7个SNPs位点(G26333A、G26336A、 C26639T、G110996C、C11 1014A、C143082G和A143135G);在IGFBP.3基因
共发现3个SNPs位点(T160G、C1087T和C4095T)。 2.IGF.IR基因外显子的G26336A和C11 1014A位点分别导致~u I和HiM I酶切 位点的改变。 3.IGF.IR基因7个SNPs位点全部位于编码区,突变都未导致氨基酸的改变。鸡群 体在IGR3-1位点上偏离Hardy-Weinberg平衡,其余位点符合Hardy.Weinberg平衡。
4.IGFBP.3基因3个SNPs其中1个位于内含子区,2个位于外显子非编码区。鸡 群体在IBP2—1位点上偏离Hardy—Weinberg平衡,其余位点符合Hardy.Weinberg
平衡。
5.IGF.IR基因IGR2-1和IGRl 6(IGRl6.1、IGRl6.2)位点对京海黄鸡300日龄产 蛋数有显著的影响(氏O.05),推测IGF.IR基因可能是影响京海黄鸡繁殖性状的 的主效基因或与主效基因相连锁的一个标记。在IGR2.1位点上,AA和AB基因
型个体在300日龄产蛋数上显著高于BB型个体(闷.05),IGR2.1位点在京海
黄鸡300日龄产蛋数的标记辅助选择方面具有很大的应用潜力。
6.IGF.IR基因IGR2.1、IGR2.2(A1u I)、IGR2.3、IGR3.2(Hinl I)和IGRl6
II(IGRl6.1、IGRl6.2)位点对京海黄鸡的生长性状具有显著的影响(尸0.05),
II
(IGRl6.1、IGRl6.2)位点对京海黄鸡的生长性状具有显著的影响(尸0.05), 推测IGF.IR基因可能是影响京海黄鸡生长性状的主效基因或与主效基因相连锁的 一个标记。在IGR2.2(Alu I)位点上,DD基因型个体在8周龄体重显著高于CC
基因型个体(氏0.05),DD基因型个体在12周龄体重显著高于CC和CD基因型
个体(Po.05),IGR2.2(Alu I 1)位点在京海黄鸡生长性状的标记辅助选择方面具 有很大的应用潜力。 7.IGF.IR基因连锁不平衡结果显示,IGRl6.1与IGRl6.2为完全连锁不平衡;IGR3.2 与IGRl6.1为强连锁不平衡。
8.IGFBP.3基因IBPl和IBP2.1位点对京海黄鸡开产日龄具有显著的影响 (火O.05),IBPl位点对京海黄鸡的生长性状具有显著的影响(PO.05)。IBPl 位点在初生重OP基因型的体重显著高于PP基因型(PO.05),在8周龄体重OP 基因型的体重显著高于OO基因型(火O.05)。 关键词:京海黄鸡:遗传多样性;IGF。Ill基因;IGFBP.3基因;单核苷酸多态性
IIISingle
III
Single Nucleotide Polymorphism of lGF—IR and IGFBP-3 Gene Associated with Production Performance in Jinghai Yellow Chicken
Ph.M Candidate:Jin Chong—Fu
Supervisor:Pro£Wang Jin—Yu
Maj or:Animal Genetics,Breeding and Reproducti on
(College ofAnimal Science and Technology,Yangzhou University,Yangzhou 225009)
AB STRACT
In this research,IGF.IR and IGFBP一3 gene were selected as candidate genes which affect correlate traits in Jinghai yellow chicken.PCR—SSCP,PCR-RFLP and DNA sequencing were used tO detect the SNPs of candidate genes in order to anal
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